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most recent call last): File "P:\Anaconda\lib\site-packages\bioservicesself.get_all_src_ids()[-1]['src_id'])作为最小的工作示例：
from bioservices
浏览 3修改于2020-06-27得票数 1
这是我的密码： bioservices_up_obj = UniProt() res = bioservices_quickgo_obj.Annotation_from_protein(protein=str(Brick.part_attribfor i in range(go_number):
go_id.append(str(
浏览 2提问于2014-03-13得票数 0
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我试图在安装了Python3.4的Windows 7上安装bioservices : 1.2.5。路径包含脚本，但在尝试使用“pip”时仍然存在语法错误。我试图通过以下方式安装“生物服务”：sudo easy_install bioservices运行pip install bioservices后，在Windows powershell上出现此错误
命令python
浏览 5修改于2020-06-26得票数 0
我想通过bioservices从Uniprot检索翻译后修改(PTM)数据，我使用以下脚本：
u = uniprot.UniProt()
浏览 5修改于2020-06-27得票数 1
我刚开始使用bioservices软件包。现在，我将使用它检索两个引用的PMID，给定指定的信息，这是我尝试过的代码：s = EUtils()
print(s.ECitMatch(
浏览 1修改于2020-06-04得票数 1
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有一个名为BioServices的接口，可以通过pip install bioservices下载。我已经成功地在串行中做到了这一点，但这需要时间，并将从并行中受益。bio=bioservices.BioModels() #initialize the class for downloading models
m=bio.getAllCuratedModelsId(
浏览 8提问于2016-11-13得票数 0
InChI=1S/C6H14N2O2/c7-4-2-1-3-5(8)6(9)10/h5H,1-4,7-8H2,(H,9,10)/t5-/m0/s1是否可以使用bioservices将两者相互转换，如果不能，是否可以以某种方式将unichem中的函数与InChI而不是InChIKey一起使用我试过：u = Uni
浏览 5提问于2017-09-01得票数 0
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file: line = line.strip()from bioservices.kegg import KEGG
# Data Parsing | Writing to File
浏览 2修改于2020-06-27得票数 1
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下面是我的代码：pdb_file = bioservices_pdb_obj.getFile(results[str(Brick.part_attrib
浏览 2修改于2015-03-13得票数 2
我有以下代码：from bioservices import KEGGParser, UniProt, QuickGO
print 'Gene: {} \t UniProtID: {}'.format(list_of_genes[i],b[i])
搜索GO术语(使用bioservices错误起源于bioservices模块(所以当我调用q.Annotati
浏览 5修改于2020-06-26得票数 2
我有以下函数(属于类)：from bioservices import KEGGParser, UniProt, QuickGO
def locate_common_GO(selfuniprot IDS using hugo2uniprot. hugo2uniprot is a custom method of my Retrieve_Data class (which uses bioservices
浏览 5修改于2020-06-27得票数 1
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我能想到的最好是2跳映射:使用eutils (或者更确切地说，使用bioservices.eutils Python模块提供的eutils接口)将GI号映射到Entrez基因ID，然后使用HGNC中的综合表将这些我尝试使用Python的bioservices.eutils库来完成这个映射的第一步，但是这样只能获得大约四分之一的2KGI数字的Entrez基因I。更具体地说，这就是我所使用的，本质上：xml = s.ELink(db='gene
浏览 4修改于2020-06-27得票数 0
from bioservices import UniProtd = u.search("yourlist:M20211203F248CABF64506F29A91F8037F07B67D133A278O
浏览 6提问于2021-12-08得票数 0
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我们可以通过ChEBI这样做：
kegg_entry = kegg_con.parse(kegg_con.get
浏览 7提问于2017-09-01得票数 0
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到目前为止，我只能手工下载urls：import webbrowser
def mapping(df, map_list
浏览 6修改于2021-06-12得票数 2
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(XXX为AWS审查的证书)import pandas as pdimport csv
from bioservices import UniProt
浏览 5提问于2022-01-04得票数 0
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如果我现在试着：kegg_con = KEGG()
res = kegg_con.get('b3640', parse=True)['NAME']
浏览 4修改于2016-08-16得票数 2
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