因此,我有一个定义为"line“的值列表。与其将大列表放入我的代码中,我想输入“行”以使代码更短。
import io
import pandas as pd
from bioservices import UniProt
from sqlalchemy import create_engine
u = UniProt(verbose=False)
d = u.search("id: (line))", frmt="tab",
columns="id,protein names,organism,go(molecular function),go(biological process),go(cellular component),sequence")在这里,我简单地把它放在括号中,这样列表中的元素就可以在我的搜索中用作"id:“,但是它似乎不承认它是我定义为"line”的列表,而只是空的。
发布于 2022-01-02 02:23:41
首先,您没有定义list。它没有打印任何内容,因为变量list是空的。第二,您必须更改第6行中的代码格式,它应该是d = u.search(f"id: {line}", frmt = "tab",。
https://stackoverflow.com/questions/70547515
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