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我在用纯素食者做DCA的圣职。我想要显示我的分组站点，但是当我使用ordispider时，分组的标签相互隐藏。我如何调整他们的位置？是否可以以某种方式使用orditkplot？
浏览 0修改于2013-05-18得票数 1
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我不相信像Vegan这样的软件包会对此有所帮助，因为我不是在寻找物种积累曲线，而是需要根据丰度数据和植物物种的保守系数来计算度量标准(如果我错了，请纠正我！)
浏览 4提问于2020-02-29得票数 2
代码：错误信息：package ‘vegan’ is not available (for R version 3.3.2)"
浏览 4修改于2019-10-22得票数 0
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我已经将vegan::adonis()作为一种替代函数进行了探索，但我不知道如何提取距离。我使用沙丘附加了一些样本数据，并将其中一个因素重新编码为“年份”。# Species and environmental datarequire(usedist)
dune <- read.delim ('https://raw.githubusercontent.com
浏览 9修改于2022-07-27得票数 2
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在我的控制器中，我有(编辑掉一些不相关的代码)： public function show(Company $id){
'vegetarian' =>
浏览 11提问于2019-10-04得票数 0
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我正在使用vegan包中的adonis函数来确定几个不同因素之间社区(PCB同类者)的不同之处。我还决定使用simper函数来评估哪些社区成员对观察到的差异做出了最大贡献。
浏览 5修改于2021-08-19得票数 2
我有一个CCA在素食，并试图绘制它，但只得到一个非常基本的情节，我想知道我如何才能自定义的情节-改变颜色的物种单词和箭头，在点，改变大小的单词在绘图上…这是我用来制作CCA并绘制它的代码(在Vegan中
浏览 8提问于2019-11-20得票数 0
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我试图计算物种的丰富度和超的网站列表。然而，我一直收到这样的错误消息：我不完全确定错误信息是什么意思。当我使用“站点”类别时，当试图查找某个国家的值(例如)时，Specpool使用相同的数据集。有人有什么想法吗？
浏览 7提问于2015-12-01得票数 0
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非常感谢pco2 <- capscale(vec2 ~ 1, add = TRUE)ordiplot(pco2, display = 'sites', type
浏览 5提问于2016-08-04得票数 2
与BiodiversityR和Vegan相关的所有文献都表明，在计算费舍尔α多样性指数时，可以使用参数se=TRUE来估计标准误差。但我似乎无法在输出中得到这些值？有没有人知道任何相关的臭虫？
浏览 0修改于2017-04-26得票数 2
我的脚本：matrix_s = read.table('matrix_s.txt', sep = "\t", header = TRUE)
matrixfit4 <- metaMDS
浏览 2修改于2016-09-26得票数 0
7.3.51.3 cannot be unloaded:
Error in unloadNamespace(package) : namespace 'MASS' is imported by 'vegan
浏览 59提问于2020-06-16得票数 2
install.packages("vegan")
Dataveg2018A <- subset(DatasetMerg, Year == "2018" & Block
浏览 2提问于2019-02-21得票数 0
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as.double(x), nr = N, nc = ncol(x), d = double(N * : [1] vegan
浏览 0提问于2018-04-18得票数 0
你好，StackOverflow社区，让我解释一下:我有一个丰度数据集，其中的列是不同的物种(N=120)，行是横截面(460)。删除了具有横断面代码的列1。丰度以N表示(不是相对的，也不是变换的)。大多数物种是稀有到非常稀有的，少数物种具有非常高的丰度(10000-30000)。总共N个个体大约是100000个。
当我运行decorana函数时，它会返回此信息。
浏览 2提问于2015-08-29得票数 0
SpecB SpecC2 3 2 4
3 1 1 1 计算alpha分集的方法如下： vegan
浏览 157提问于2021-09-24得票数 0
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这就是我想把文本标签放在箭头指向的位置上：以下是我的研究结果：我想把文字标签放在箭头指向的位置，我使用了库(Ggrepel)。 p <- ggplot(rda_tb_fs.site, aes(RDA1, RDA2)) + geom_hline(yintercept = 0, color = 'gray', size = 0.5) +
geom_segment(d
浏览 6修改于2022-10-02得票数 0
我正在尝试对一个大型数据集执行NMDS排序，该数据集包含超过50个不同时间点和不同采集点的样本点。每个采样点都有数千个为其排序/组装的OTU。然而，我想添加省略号，而不必经历前面问题中所示的繁琐且可能容易出错的手动添加元数据的过程。我想知道如何为所有的'NP‘点创建椭圆-以及所有其他不同的样本站点。它们都是由一个特定的缩写命名
浏览 3修改于2017-05-23得票数 1
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