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我在自己编写的生物信息学管道中使用Python语言中的ete3()包。Traceback (most recent call last): load_entry_point('ete3
浏览 34提问于2020-05-12得票数 0
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如果树枝长度小于指定的限制，是否有一种简单的方法使用ete3 (或其他库)来清理分支树？\---|那么生成的树应该如下所示： |--| \---|我试过这样做：
from ete3
浏览 5提问于2022-02-18得票数 0
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我是linux用户，到目前为止，我已经成功地在python2中使用了ete3。有关于如何解决这个问题的线索吗？.>>> from ete3 import Tree
>>> from ete3
浏览 46提问于2018-03-09得票数 0
我阅读了所有关于侧面热图生成的文档，但我找不到任何方法来向ete3生成的热图添加标签。例如，在下面的代码中，热图的7列具有名称'Marker1‘到'Marker7’。有没有办法将这些名字添加到ete3生成的热图中，就像“BarChartFace”中的“labels”选项一样？或者，唯一的方法是将树移植到matplotlib，然后在那里添加标签？from ete3 import Tree, TextFace, NodeStyle, TreeStyle, faces, AttrFace, ClusterTree, Profi
浏览 18修改于2018-07-17得票数 3
Traceback (most recent call last) 1 from ete3, w=183, units="mm")
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/ete3drawer.get_img
浏览 24修改于2017-05-23得票数 0
我正在使用python中的ete3包根据我用随机模型生成的数据构建系统发育树，它运行得很好。这两个方法都称为Tree，所以我通过导入树状方法来解决这个问题，比如：ete3方法如下：
from ete3 import Tree我有一个循环，首先使用ete3方法构建树对象，我称之为t‘。然后，我的计划是使用ete3中的ete3方法将树状图传递给Dendropy，使用'get‘方法并跳过实际的外部文件位，如下所示
浏览 3修改于2016-09-11得票数 2
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我如何让ete3指定在分类等级中哪个等级的血统I对应？import ete3taxon_id = 505
lineage = ncbi.get_lineage(taxon_id
浏览 4提问于2017-09-10得票数 2
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我试图弄清楚如何从一个ete3.Tree有向图构建一个networkx对象？我以我认为会产生预期结果的方式添加了每个child，但我遇到了麻烦。
edges = [('lvl-1', 'lvl-2.1'), ('lvl-1', 'lvl-2.2'), ('lvl-2.1', 'lvl-3.1'), ('lvl-2.1', 2), ('lvl-2.2', 4), ('lvl-2.2', 6), ('lvl-3.1', 'lvl-4
浏览 1修改于2018-07-11得票数 2
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如何为ETE3 python模块中的指引线(使用连接叶子节点和文本)添加不同的颜色。
谢谢
浏览 21修改于2016-09-12得票数 1
具体地说：
Ltax = [561863, 333367, 518636, 1262999,
浏览 13修改于2018-08-02得票数 0
例如，下面的代码读取一棵树并显示它：
t = Tree("(2azaa:0.1871453443,1dz0a:0.1944528747, (((1joi
浏览 5修改于2017-04-15得票数 1
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/ete3/...我首先打开Python3.7： /beegfs/home/me/.conda/envs/mypython3/bin/python3.7 我将其称为ete3包： from ete3 import * 但是ete3不是来自/beegfs/home/me/.conda/envs/mypython3/lib/python3.7
浏览 7修改于2019-12-24得票数 0
示例：RUN pip3 install -U -r ete3
但是，如果我删除了RUN指令，完
浏览 8修改于2022-10-11得票数 1
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我需要导入一个名为ete3的包：以下是我的问题：~/path1/path2/ete3~/path1/path3/ete3我手动更改了其中的一些命令行：~/path1/path3/ete3，但是当我在python3.7中调用ete3时，它调用这里的命令行：~/path1/path2/<em
浏览 4提问于2019-12-24得票数 0
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export PATH=~/anaconda_ete/bin:$PATH;
conda install -c etetoolkit ete3ete_toolchain
ete3 build check错误：
UnsatisfiableError:发现以下规范与您的环境中现有的python安装不兼容
浏览 2提问于2019-08-19得票数 0
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