回答情况：
提问时间：
问题标签：
2回答
我对Linux完全陌生，因为我需要的一些生物信息学研究程序要么只在linux上工作，要么很容易在linux上操作。( 1)下载程序2)通过以下步骤：cd mothur
浏览 0修改于2016-12-21得票数 0
显然，安装所有的生物导体包并不那么麻烦biocLite(all_group())
但是，如果您只想安装那些无法在您的计算机上安装的软件包，那么应该做什么呢？
浏览 3提问于2016-11-06得票数 2
回答已采纳
1回答
例如，我的发行版没有打包的生物信息学程序需要一些特定版本的R。碰巧，该程序是通过一个名为“生物导体”的项目提供的，该项目的目标是为生物信息学提供R包，确保软件包彼此兼容(参见https://www.bioconductor.org/install/#why-biocLite因此，我决定不使用我的操作系统包装管理系统的R，并安装所有通过biocLite命令提供的生物导体项目。这种方法运行了一段时间，直到我发现为了保
浏览 0修改于2017-09-14得票数 14
回答已采纳
我需要biomaRT，但它没有安装。我该怎么解决这个问题？生物导体版本3.14 (BiocManager 1.30.16)，R4.1.3 (2022-03-10)警告消息:当版本与当前版本相同时未安装软件包；使用force = TRUE重新安装：“biomaRt”
浏览 15提问于2022-04-07得票数 0
我正在尝试安装"cytofkit“R-包，并参考使用biocLite("cytofkit")source配置:生物导体版本3.14 (BiocManager 1.30.18)，R4.1.2 (2021-11-01) R，Windows警告信息: 1:生物导体版本“3.14”不提供“cytofkit”软件包
浏览 4提问于2022-05-23得票数 0
回答已采纳
我试图安装'Rsubread‘软件包，但我得到这个错误，我是新的R，所以我不知道我应该如何解决它。我在windows 8.1上使用Rstudio
来源(“”)生物导体版本3.2 (BiocInstaller 1.20.1)，?biocLite for help biocLite("Rsubread") BioC_mirror:使用生物导体3.2的 (BiocInstaller 1.20.1)，R 3.2.3 (2015-12安装只有源代码形式的“Rsubread”软
浏览 2提问于2016-02-23得票数 1
问题：下面的链接建议我应该将在包的说明文件中自动安装生物导体包。
biocViews:在Imports:的上
浏览 0提问于2019-01-28得票数 5
我正在尝试使用conda来安装一些生物信息学软件，比如cufflink：但是我得到了这个错误：
Error: Invalid index
浏览 17提问于2018-08-29得票数 1
我是Ubuntu的新用户，我一生都在使用windows，但是最近我需要安装Ubuntu，所以我可以使用一些只适用于Linux操作系统的生物信息学软件。我试过使用VirtualBox，但速度慢得令人痛苦，不允许我运行我需要的用于DNA序列分析的所有软件。这最后一个选项会不会降低我的计
浏览 0修改于2018-11-16得票数 3
当试图安装生物导体(用于安装phyloseq包)时，我会收到几条警告和错误消息我得到的错误消息是：
采用生物导体3.7 (BiocInstaller 1.30.0)，R 3.6.0(2019-04-26).
浏览 0修改于2019-05-24得票数 2
无法完全安装和更新Ubuntu中的“生物导体基础包”。我正在尝试更新生物导体的核心包，但我得到了一个错误：
使用生物导体3.7 (BiocIns
浏览 3修改于2019-07-17得票数 1
包gRbase、gRain和gRim (我维护的)都使用了生物导体上的包RBGL、图形和Rgraphviz的功能。这意味着用户不能直接安装我的软件包(必须做setRepositories -> BioC软件)。当然，这不是世界上最大的问题，但它是一个巨大的问题，它会给人们带来麻烦，或者让一些人放弃使用我的软件包。我的问题是:是否有任何规定，例如在描述中，必须从生物导体安装RBGL、图形和Rgraphviz，这样我的包的用户就可以避免这种麻烦了吗？如果有办法解决这个
浏览 8提问于2022-09-30得票数 2
我们希望采用现有的基于Linux的AMI，在其上安装我们的软件，并使修改后的AMI公开可用。这样做的许可含义是什么？我们的软件是一个开源的生物信息学工具，但不使用GPL兼容的许可证。我担心的是，修改后的AMI将是一个派生的作品，我认为这将使我们有义务在GPL兼容的许可证下许可我们的软件。
浏览 0提问于2011-08-04得票数 1
2回答
我试图使用"devtools“在R3.6上安装RADammi软件包，但是我收到了以下错误：install.packages("BiocManager")
生物管理器：：安装(“<em
浏览 0修改于2020-01-30得票数 0
我在Ubuntu 14.04上的R版本3.1.2上安装了生物导体软件包，并收到了以下消息：
这是什么意思，它是如何影响使用上述软件包的R？
浏览 1修改于2015-02-17得票数 9
无论如何，我想在Pythonanywhere上安装几个生物信息学软件包。Biopython为这些工具提供了包装器，但是您仍然需要安装实际的工具。这些工具没有pip或easyinstall兼容性。
浏览 1修改于2015-08-19得票数 0
我想把我为Windows编写的一些GUI程序带到Ubuntu软件中心。我正在使用几个外部命令行工具，我用不，我想知道在Linux (Ubuntu)下如何做到这一点。在Windows中，该工具只能在我的程序的文件夹中访问，但没有安装，它是否会以同样的方式在Linux上工作？任何帮助都是非常感谢的！
浏览 3修改于2012-07-27得票数 0
回答已采纳
目前版本的软件包，我想使用的是失败的生物导体。然而，旧版本曾经起作用。提前谢谢。与R不同的是，企业中使用的软件确实有非功能性的需求，允许在现实生活中使用它们。
浏览 1修改于2022-06-01得票数 11
回答已采纳
我和生物导体一起工作，我想安装ShortRead软件包。我已经尝试过很多次了，但是安装依赖程序包RCurl时出错了。
浏览 4提问于2012-08-16得票数 1
如果出现错误，它将失败：
电话: sqliteNewConnection(drv，.)错误:RS驱动程序：(无法连接到输入关于如何在出版物中引用R或R包的更多信息和“引文()”，输入“贡献者()”。安装软件包'GO.db‘尝试URL '’内容类型'application/zip‘长度为27089981字节(25.8 Mb)打开的URL下载了25.8Mb下载的二进制包在GO.db中
库(“GO.d
浏览 2提问于2014-06-02得票数 0
回答已采纳
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号