无法安装RADammi包

Question

我试图使用"devtools“在R3.6上安装RADammi软件包，但是我收到了以下错误：

将包安装到‘C:/User/taham/Documents/R/win-library/3.6’(未指定为‘lib’)

错误:依赖项“Biostring”、“IRanges”无法用于包“RADami”*删除RADami

错误:未能从URL：(从警告转换)安装包>‘C:/Users/taham/AppData/Local/Temp/RtmpycMnQ2/remotes11246cb38f0/RADami’的非零退出状态安装“未知包”。

这是一个从CRAN https://rdrr.io/cran/RADami/中删除的旧包。

我该怎么安装它？

更新:我最终可以使用下面的命令来安装这两个依赖项：

if (!requireNamespace("BiocManager"，BiocManager= TRUE))

install.packages("BiocManager")

生物管理器：：安装(“生物字符串”)

生物管理器：：安装(“IRanges”)

我已经下载了压缩存档的RADami文件并试图安装这个包，我再次收到了这个胎错误：

install.packages("C:/Users/taham/Downloads/RADami_1.1-2.tar.gz"，repos = NULL，

=“”)

将软件包安装到‘C:/Users/taham/Documents/R/win-library/3.6’(未指定为‘lib’)

• 安装源代码包“RADami”.

**包'RADami‘成功解压缩并检查MD5和

**使用分期安装

** R

**数据

**

**字节-编译并准备用于延迟加载的包

错误:对象'c.phylo'，'c.multiPhylo‘没有由’命名空间:ape‘导出，执行停止

错误：“RADami”包延迟加载失败

去除'C:/Users/taham/Documents/R/win-library/3.6/RADami'的

install.packages中的警告：

软件包‘C:/Users/taham/Downloads/RADami_1.1-2.tar.gz’的安装具有非->零退出状态。

我在使用devtools时也会遇到同样的错误

Answer 1

听起来，您需要首先从BioConductor安装"IRanges“和”Biostring“：

library(devtools)
install_bioc("IRanges")
install_bioc("Biostrings")

尽管它们还有其他依赖项，如"S4Vector“，但您可能也需要手动安装这些依赖项。

然后，您应该能够安装RADami：

install_url("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/RADami/RADami_1.0-3.tar.gz")

Answer 2

我在从CRAN存档中安装时也遇到了这个问题，但是成功地从开发人员的Github安装了它。在R：

library(devtools)
install_github("andrew-hipp/RADami")