加载BioConductor库"GO.db“失败

Question

加载BioConductor包"GO.db“时有问题。如果出现错误，它将失败：

错误：.onLoad在“go.db”的loadNamespace()中失败，详细信息： 电话: sqliteNewConnection(drv，.)错误:RS驱动程序：(无法连接到dbname:无法打开数据库文件)错误:包或命名空间加载“GO.db”失败

我在Windows 8环境下工作，使用R3.1.0和生化导体2.14 (最新版本)。

请帮帮忙。

全部数据：

R版本3.1.0 ( 2014 -04-10) -“春舞”版权(C) 2014统计计算平台R基金会:x86_64-W64-mingw32 32/x64(64位) R是免费软件，绝对没有保修。欢迎您在某些情况下重新分发。键入'license()‘或’license()‘以获取分发细节。 R是一个与许多贡献者协作的项目。输入关于如何在出版物中引用R或R包的更多信息和“引文()”，输入“贡献者()”。 在一些演示中输入'demo()‘，为在线帮助输入' help ()’，或者为HTML界面输入'help.start()‘来帮助。键入“Q()”退出R。 恢复以前保存的工作区 来源(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)生物导体版本2.14 (BiocInstaller 1.14.2)，?biocLite for help biocLite("GO.db") BioC_mirror:使用生物导体版本2.14 (BiocInstaller 1.14.2)，R版本3.1.0。安装软件包'GO.db‘尝试URL '2.14.0.zip’内容类型'application/zip‘长度为27089981字节(25.8 Mb)打开的URL下载了25.8Mb下载的二进制包在GO.db中 库(“GO.db”)加载所需的包: AnnotationDbi加载所需的包: BiocGenerics加载所需的包:并行附加包：‘BiocGenerics’ 以下对象被隐藏在“包:并行”中： clusterApply，clusterApplyLB，clusterCall，clusterEvalQ，clusterExport，clusterMap，parApply，parCapply，parLapply，parLapplyLB，parRapply，parSapply，parSapplyLB 以下对象被隐藏在“package:stats”中： xtabs 以下对象被隐藏在“package:base”中： anyDuplicated、追加、as.data.frame、as.vector、cbind、colname、do.call、复本、eval、evalq、筛选、查找、获取、相交、is.unsorted、lapply、Map、Map、match、mget、order、pmin、pmin.int、位置、等级、重新绑定、减少、rep.int、行名、sapply、setdiff、排序、表、tapply、union、唯一、未列出列表 装载所需包装:生物基地欢迎来到生物导体 小片段包含介绍性材料；使用'browseVignettes()‘查看。要引用“生物导体”，请参阅“引文(”Biobase“)和软件包”引文“(”pkgname“)。 加载所需的包: GenomeInfoDb加载所需的包: DBI错误：.onLoad在“go.db”的loadNamespace()中失败，详细信息： 电话: sqliteNewConnection(drv，.)错误:RS驱动程序：(无法连接到dbname:无法打开数据库文件)错误:包或命名空间加载“GO.db”失败

Answer 1

我也有过同样的问题。尝试将R重新安装到另一个目录(另一个磁盘)。这对我有帮助。