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我使用R中的rentrez包搜索PubMed，并希望得到按相关性排序的结果。目前，它们是按发布日期排序的。library(rentrez)
entrez_search = entrez_search(db="pubmed", term
浏览 8修改于2017-10-20得票数 4
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我正在使用rentrez包中的entrez_fetch成功地获取作者姓名、出版年份和其他信息。以下是我的示例代码：library(XML)
这个问题真的很困扰我，我真的很感激任何帮助或指导。提前感谢您的努力和帮助。
浏览 22修改于2017-02-26得票数 1
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到目前为止，我已经能够制作一个脚本，该脚本可以使用rentrez包从ncbi中获取蛋白质序列。然而，我无法使它在一个闪亮的应用程序中工作。现在，我想使用rentrez下载蛋白质序列。
浏览 0修改于2018-09-24得票数 0
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我正在尝试使用rentrez包查找具有PubMed条目的SNP列表。当我运行下面的代码时，我得到了一个空的数据帧。我想我没有正确地写入数据帧。library(rentrez)
'AKR1C2
浏览 4修改于2017-10-20得票数 0
我在使用rentrez解析XML文件时遇到问题。我正在尝试通过每个pmid ( PubMed数据库中的文章id )作为输出的作者和从属关系。我有代码，工作良好，除非作者有多个从属关系。PubmedData></PubmedArticleSet> library(rentrez
浏览 6提问于2017-03-04得票数 1
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我正在使用PubMed挖掘rentrez数据。我将修改我的代码，根据entrez_search返回的结果数来计算entrez_search，但我不知道为什么rentrez或NCBI会这样做。有什么想法吗？term_set = "transcription AND enhancer AND promoter AND 2017:2018[PDAT]"> library(rentrezterm_set = "transcription AND enhancer AN
浏览 1提问于2018-07-16得票数 0
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我不知道如何在我的查询中使用rentrez同时获得作者姓名和各自的从属关系。我可以得到这两个信息，但我的从属关系列表比我的作者列表少了大约300人，所以很明显，有些人没有提供从属关系，但我不知道是谁。library(tidyverse)library(XML)
trial<-entrez_fetch(db="pubmed", id=pub.list$PMID,
浏览 5修改于2017-10-20得票数 3
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tl;dr:由rentrez生成的摘要列表有什么不同，为什么这些列表在使用append()合并后停止与其他rentrez函数一起工作
我正在使用rentrez访问Pubmed。
浏览 11提问于2018-08-07得票数 0
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sequence <- entrez_fetch(db="nuccore", id=**accession_number**, rettype="fasta")
Rentrez在他们的文档中说：“NCBI特别是/enumerated /item不超过每秒发送三个请求(rentrez强制执行这个限制) /item，如果您计划发送超过100个请求的序列，对于大型请求则在高峰时间之外使用web历史方法(见entrez_search
浏览 11修改于2022-04-02得票数 0
我有以下R码：Prot_ids <- c("XP_012370245.1","XP_004866438.1","XP_013359583.1")
links <- entrez_link
浏览 6修改于2017-10-20得票数 1
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所以我尝试使用rentrez包从GenBank检索DNA序列数据，给出一个物种列表作为输入。library(rentrez)
species<-c("Ablennes hians","Centrophryne spinulosa","Doratonotus megalepis","Entomacrodus
浏览 14修改于2021-03-06得票数 0
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OKRemoved empty directory ‘rentrez/inst/doc’Removed empty directory ‘rentrez/vignettes/assets’* building
浏览 1修改于2014-06-27得票数 6
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我使用的是rentrez包，但我得到的结果与其他相关的r包也是一样的，所以我猜这与API本身有关。下面是重现结果的代码： install.packages('rentrez')
rentrez::entrez_search(db="pubmed", term = '((model OR models
浏览 17提问于2021-01-21得票数 0
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install_load_packages=function(packages){ library(seqRFLP) library(data.table)
library(r
浏览 13修改于2019-06-22得票数 0
我试图使用这个R脚本从NCBI获取一些信息：require(magrittr)rss = c("rs16891982", "rs12203592given a rs number, return chr, bp, allele and gene name anno = rentrez(db = "snp", term = rs) %>%
浏览 2修改于2017-10-20得票数 1
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</MedlineCitation></PubmedArticleSet>library(XML)"26386083","26273372","26066373","25837167",
"2546
浏览 2修改于2015-11-04得票数 0
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<label for="pseudo">Rentrez un pseudo </label><input type="password" id="mdp">
<script src=&qu
浏览 6修改于2022-06-17得票数 0
我刚开始通过Biopython和几个R包(rentrez和reutil)访问Entrez。query_key, webenv = web_env, retstart = 1, retmax = 10000)而R包reutil和rentrez
浏览 3修改于2017-10-20得票数 0
##librarireslibrary(tidyverse)
keywords <- structure(
浏览 10提问于2020-05-28得票数 0
div> <input type="text" id="code" name="code" placeholder="Rentrez
浏览 3修改于2020-04-14得票数 1
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