看到vip交流群有人询问根据基因名称,批量下载碱基序列的方法,其实就是一个R包《rentrez: An R package for the NCBI eUtils API》 有意思的是,我根据rentrez ,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表) 文件读取和写出 简单统计可视化 无限量函数学习 当然了,rentrez
在R中,这个工具可以用rentrez,进行在线获取数据,可以先简单的看看它的一些官方文档描述: https://cran.r-project.org/web/packages/rentrez/vignettes /rentrez_tutorial.html https://github.com/ropensci/rentrez/wiki https://github.com/ropensci/rentrez 首先可以查看一下它提供了哪些数据库的接口 : # install.packages('rentrez') library(rentrez) entrez_dbs() 我是2023-11-23 运行的上面的代码,从返回的结果来看是非常丰富: >
用rentrez包也可以完成同样的任务.
plots with ggplot2 山脊图 介绍https://cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/introduction.html rentrez