我试图使用他们的API通过R访问Pubmed结果,但我得到的结果总是比使用web界面时相同的查询所获得的结果要少。通过深入研究输出,我注意到问题出在两种访问方法之间的不同查询转换上。
我使用的是rentrez包,但我得到的结果与其他相关的r包也是一样的,所以我猜这与API本身有关。
下面是重现结果的代码:
install.packages('rentrez')
rentrez::entrez_search(db="pubmed", term = '((model OR models OR modeling OR network OR networks) AND (dissemination OR transmission OR spread OR diffusion) AND (nosocomial OR hospital OR "long-term-care" OR "long term care" OR "longterm care" OR "long-term care" OR "hospital acquired" OR "healtcare associated") AND (infection OR resistance OR resistant)) AND (2010[PDAT]:2020[PDAT])')$count
[1] 7157对https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/的相同查询将返回9263个结果。
发布于 2021-04-13 22:33:34
不确定你现在是否还需要这个。以防其他人也有同样的问题。我遇到了与您相同的问题,我发现从GitHub问题中可能会有一些有用的东西。似乎API服务需要更新以匹配新的web服务,但现在已经一年了,官方仍然没有发布任何有希望的公告。easyPubMed作者提供了一种替代方案。希望这就是你要找的。
https://stackoverflow.com/questions/65830663
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