Rmd构建跳过针织r/Rmd小片段--“在‘build /egnette.rds’中列出的输出，但不包含在包中”

Question

我已经为一个R包构建了一个rmarkdown教程，并且希望在包构建时包含编译的文件。尽管该文件编译非常愉快(包括使用R CMD Sweave进行编译时)，但我似乎无法将其包含在二进制文件中。

具体来说，当我运行R CMD BUILD时，

* checking for file ‘./DESCRIPTION’ ... OK
[snip]
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... OK
* checking for empty or unneeded directories
Removed empty directory ‘rentrez/inst/doc’
Removed empty directory ‘rentrez/inst’
Removed empty directory ‘rentrez/vignettes/assets’
Removed empty directory ‘rentrez/vignettes’
* building ‘rentrez_0.2.4.tar.gz’

但是在安装了这个二进制文件并运行了vignette(package="rentrez")之后，这个包就没有小片段了。

那我做错什么了？

如果有帮助，库的这支将包含与包相关的小片段和相关编辑。文件本身位于vignettes/目录中，并以

<!--
%\VignetteEngine{knitr::knitr}
%\VignetteIndexEntry{rentrez tutorial}
-->

描述文件包括以下几行

Suggests:
    testthat,-
VignetteBuilder: knitr

编辑

我应该想到在构建的包上运行R CMD CHECK：

Output(s) listed in 'build/vignette.rds' but not in package:
  ‘inst/doc/rentrez_vignette.html’

据我所知，build/vignette.rds是由R CMD BUILD创建的，但我不知道为什么它指向inst/doc (即使在构建包之前删除了这个dir )。

Answer 1

问题是，您的rentrez_*在您的.Rbuildignore中，这与您的小插曲的名称相匹配。.Rbuildignore中的行应该如下所示

^staticdocs$

不

staticdocs

Answer 2

您应该删除inst/doc/。所有的小插曲都应该只在vignettes/下面。要记住的另一件事是，您应该只将源文档保存在vignettes下，并且所有生成的文件都不应该存在，例如HTML。虽然这肯定不是最好的例子，但是始终可以检查是如何构建它自己的小故事的。