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用glmmadmb解释
mcmc
输出
为了总结输出,我将总结函数与
mcmc
选项的输出进行比较。=TRUE,
mcmc
.opts=mcmcControl(
mcmc
=1000))
mcmc
.opts = mcmcControl(
mcmc
= 1000)) Estimate Std.输出:m <- as.
mcm
浏览 3
提问于2013-11-26
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PyMC
MCMC
分析- .summary()“
Distribution=pymc.Poisson('Distribution',mu=r,value=n,observed=True) import pymc M=pymc.
MCMC
(model)在得到错误的最后命令M.summary()之前,一切似乎都正常: AttributeError跟踪(最近一次调用)在() -&g
浏览 2
提问于2014-06-16
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回答
MCMC
的随机排列
我刚接触过JAGS (只是另一个吉布斯取样器),我想知道是否有可能将它扩展到随机排列空间中的样本?
浏览 3
提问于2016-02-26
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回答
爱德华的
MCMC
追踪情节
我使用(DPMM)根据下面的推断合成数据集上的集群分配和聚类参数。我用GPU加速的大都会黑斯廷斯来学习模型参数的后验分布。例如,对于集群方法,我们有:K = 5 #cluster truncationmu = Normal(loc=tf.zeros(D), scale=tf.ones(D), sample_shape=K)
浏览 5
修改于2017-09-25
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回答
MCMC
.OTU修改图
使用
MCMC
.OTU,我尝试在x轴上旋转文本。我使用的是软件包附带的dataset green.data。summ.plot=TRUE) (axis.text.x= element_text(angle=-90))如何在
MCMC
.OTU
浏览 0
提问于2016-02-05
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回答
在Python中实现
MCMC
我知道有
MCMC
算法可以做到这一点。但是,有没有人知道用Python或C实现
MCMC
采样器的好方法?或者,有没有其他方法来解决这个问题? 格言
浏览 0
提问于2013-07-19
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回答
从
mcmc
对象重构变量
我正在寻找类似的东西/现成的
mcmc
对象,但至今没有效果-我不敢相信我是第一个需要这个。显然,relist(colMeans(output[[1]]))不起作用。 有人能帮我重建吗?
浏览 5
修改于2017-04-11
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电阻抗断层成像与
MCMC
我很难使用贝叶斯方法(
mcmc
)来估计空洞或半径。有人能帮我做点什么吗?之所以这样做,是因为我是
MCMC
的新手
浏览 2
提问于2020-04-08
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1
回答
MCMC
永远无法在SAS中运行
我想使用
MCMC
构建一个模型,但我不确定这是否可能(我在SAS中运行)。我有我的所有参数的先验,当我在SAS中运行
MCMC
时,它需要几个小时才能运行。
MCMC
可以处理210随机项的随机交互吗?我使用
MCMC
是因为我想利用前几轮建模中的先验知识,但如果它需要永远运行,那就没有意义了。proc
mcmc
data=modeldbsubset outpost=postout thin=1000 nmc=20000 seed=7893 monitor=(b0 b1);
浏览 23
提问于2019-01-03
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回答
Tensorflow
MCMC
不进化链状态
一般来说,我是tensorflow和
MCMC
的新手。我正在用不同的模型做一些基本的计算,最基本的模型没有问题地收敛,并且从
MCMC
计算中得到了很好的结果。我通过下面的代码调用采样器: target_log_prob_fn=_tf_lnlike, step_size=0.1) adapt_kernel = tfp.
mcmc
浏览 4
修改于2020-12-30
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回答
在R中操作
mcmc
.list对象
我使用通过rjags调用的JAGS来生成
mcmc
.list对象foldD_samples,它包含大量随机节点(>800个节点)的跟踪监视器。现在我想使用R来计算这些节点的一个相当复杂的标量值函数,并将输出写入
mcmc
对象,这样我就可以使用coda来总结后继和运行收敛诊断。下面是
mcmc
.list的结构:List of 3 $ :
mcmc
[1:5000, 1:821] -0.667 -0.197 -0.302 -0.204 -chr [1:821] "beta0&
浏览 1
修改于2015-11-15
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winbugs中的
MCMC
代码
我最近开始学习它,现在我想写一个代码,用
mcmc
方法预测一些变量。方程是: R=a1*U + a2*B + a3*D^a4 + a5*S^a6 + a7。
浏览 5
修改于2017-07-24
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回答
如何将
MCMC
诊断转换为Latex表?
我正在使用coda包来计算我的
MCMC
的汇总统计信息。但是,似乎没有将打印的摘要转换为Latex表的选项。我尝试过stargazer,并将summary.
mcmc
结果转换为数据帧。两次尝试都失败了。下面是一个可重复使用的示例:mock_
mcmc
<-
mcmc
(rnorm(1000))summary.
mcmc
将打印出来 1.
浏览 0
修改于2016-04-13
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回答
R中尾波中
mcmc
函数的细化
对于在给定数据的情况下声明
mcmc
对象的coda文档,我有点困惑。“同样地,如果数据表示已经细化的链,则应将细化间隔作为瘦参数。”换句话说,如果我原来的
MCMC
链是:0 1 2 3 4 5 6,而我的细化间隔是2,那么我计划在尾数中提供给
mcmc
函数的数据就是0,2,4,6。谢谢!
浏览 3
提问于2017-06-30
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内存耗尽,试图从大
mcmc
.list中提取
我在试图从大型
mcmc
.list中提取单个变量时遇到了问题Error: cannot allocate vector of size 146.8Mb> object.size(outRJ$
mcmc
)/1024如何在不需要太多内存的情况下从大型
mcmc<
浏览 0
修改于2020-06-20
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回答
R中的
MCMC
变点模型
我想运行
MCMC
线性高斯多变点模型来检测连续值的时间序列向量的变点。) sigma.mu=sd(X)model1 <- MCMCregressChange(X ~ 1, m=1, b0=mean(X),
mcmc
sigma.v
浏览 20
提问于2020-07-31
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回答
如何利用
MCMC
分解混合分布
我使用的是tfd.Mixture和tfd.Normal和tfd.Deterministic,已知的(在样本数据情况下)正常与确定性的比率是0.5,我的
MCMC
则返回一个0.83的比率,以支持正常值。tfb.Identity(), # munum_burnin_steps = 50000 inner_kernel=tfp.
mcmc
.HamiltonianMo
浏览 3
修改于2021-03-06
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回答
绘制二项式
MCMC
我正在努力解决二项式和pymc的问题,我有一个分成组的样本,我想用
MCMC
评估从易感状态到感染状态的转换率,并以类似于的方式绘制结果。import scipy as scfrom scipy.stats.mstats import mquantiles reload(mod)mc.sample(ite
浏览 1
修改于2013-10-25
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回答
在jags /rjag/ runjags中裁剪
mcmc
.list
我把R中runjags模型的输出作为
mcmc
.list。下面是生成3条1,000个样本链的代码。我想把所有的12条链都剪到最后的400个样品上。我可以拆开链子,把链表输出的矩阵保存在一个列表中,但是它不再是一个
mcmc
.list,我也想不出如何把它变成一个
mcmc
.list。下面是运行runjags模型并将输出转换为
mcmc
.list的一些数据model {for (i in 1:N){sample = 1000,
浏览 1
修改于2018-04-25
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回答
MCMC
中的参数数量
我想使用pymc包从我的后验分布中进行采样。
浏览 1
修改于2015-05-10
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