内存耗尽，试图从大mcmc.list中提取

Question

我在试图从大型mcmc.list中提取单个变量时遇到了问题

> x <- outRJ$mcmc[,'avail_int']
Error: cannot allocate vector of size 146.8 Mb

outRJ$mcmc mcmc.list很大，实际上是442 MB (包含3个链的数据，每个变量有960个，每次迭代20000次)：

> object.size(outRJ$mcmc)/1024/1024
[1] 442.5508 #

但是单变量应该只有234个kB！但是它的提取似乎需要更多的内存！

如何在不需要太多内存的情况下从大型mcmc.list中提取？

Answer 1

当前的子设置代码(在函数[.mcmc.list)中)正在对列表的每个元素进行复制，然后再对其进行设置。我已经修改了coda开发版本中的代码。在此期间，马特的解决办法应该做，因为它也避免了多余的副本。

Answer 2

我认为这应该是可行的：

 x <- as.mcmc.list(lapply(outRJ$mcmc, function(x) return(x[,'avail_int',drop=FALSE])))

哑光