R中尾波中mcmc函数的细化

Question

对于在给定数据的情况下声明mcmc对象的coda文档，我有点困惑。

它说(来自第21页的文件)：

“同样地，如果数据表示已经细化的链，则应将细化间隔作为瘦参数。”

目前，我计划输入到这个函数的数据集已经因为细化而被丢弃了。换句话说，如果我原来的MCMC链是:0 1 2 3 4 5 6，而我的细化间隔是2，那么我计划在尾数中提供给mcmc函数的数据就是0,2,4,6。

这就是文档所指的已经被“细化”的链吗？如果是这样的话，为什么我需要指定thin = 2？

换句话说，我在辩论是否应该这样调用函数，假设data = c(0,2,4,6)：mcmc(数据，thin = 1)还是mcmc(数据，thin = 2)？

谢谢!

Answer 1

数据= c(0,2,4,6)是mcmc(data, thin = 2)。

如果你是plot(mcmc(data, thin = 2))和plot(mcmc(data, thin = 1)，你就会看到这一点。在瘦=1的情况下，图中的迭代次数将减少。