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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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Develop |- Commit 2 |- Merged pull request #1 from user/branch/name
2&3在发展史上出现的原因
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
我有一个newick格式的猫家族的发展史，当我试图在文件中阅读时，我会得到以下错误：
phy<-read.tree("phylogeny.txt")在if (sum(obj[i]$edge，1 ==
浏览 5修改于2016-05-17得票数 0
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$treeDisplay <- renderPlot({ })
shinyApp(ui, server) 根据bretauv的建议，这里是读取系统发展史并绘制系统发展图的代码
浏览 24修改于2020-02-05得票数 1
最近，我尝试在java中创建一个黑桃游戏。我已经成功地制作了卡片和牌类，但是每当我试图打印出一张随机卡片或一副牌，没有2颗钻石和球杆，我就会有一个意想不到的结果。String outputJoker() return value + " " + suit;甲板级：import java.util.Random;
privat
浏览 6提问于2015-08-30得票数 0
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我现在正在和一些人交谈，他们告诉我，如果我在将来从事Java编程的工作，我不应该花太多的时间学习Java SE，我应该花时间学习Java。这让我想到了一些问题。有什么好书可以让我阅读来学习Java吗？谢谢!
浏览 0提问于2011-08-15得票数 4
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我们有一个当前的Java项目，以及在项目中引入一个webservice的新要求。我们在Rad 7上开发并部署到Websphere 6.1，但是这种情况可能很快就会改变到部署到tomcat上。什么是最好的方法，或者人们认为用Java创建way服务的最新和最好的方法是什么？
浏览 3修改于2013-05-26得票数 2
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如果您可以使用Java se restlet开发web服务，那么为什么还要使用Java呢？其中一个的优点是什么？我应该在什么时候以及为什么要使用每一个？
浏览 4修改于2014-01-10得票数 0
我正在寻找Java应用程序'A‘和另一个Java应用程序'B’之间的通信。我收到了JNI，网络服务和其他的消息.对我来说重要的是以下几点：
对其他开发人员开放(他们只需实现我的接口)
浏览 6修改于2013-08-08得票数 0
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