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问多个热解树(multiPhylo对象)上的R-运行函数
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Stack Overflow用户

提问于 2018-01-04 22:23:53

回答 1查看 310关注 0票数 1

我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。

例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。我知道对于一棵树，我可以使用：

sum(tree$edge.length)

但我不知道如何对multiPhylo中的所有树执行此操作。我相信这很简单，但我无法理解。有人能帮上忙吗？

谢谢

丹

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发布于 2018-01-05 21:17:36

multiPhylo类是一个列表(str(tree))，因此提供了R用来处理列表的功能。要对单个树的边长求和，请使用lapply函数。

lapply(tree, FUN = function(x) sum(x$edge.length))

票数 3

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/48097273

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