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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。, tree.scaled$edge.length, mode=c("edges"),palette="rainbow", use.edge.length = FALSE, node.depth = 2)
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
开发分支看起来像 |- Commit 1Feature |- Commit 2 (New commit在合并开发的提交历史之后，使用GitHub合并拉请求按钮进行合并，如 |- Commit 1 |- Commit 32&3在发展史</em
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。$tip.labels的输出：old_species_name_1old_species_name_3new_taxonomic_namesnew_species_name_2...
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。示例输入数据(2列，一列用于索引，一列用于物种)：A ; Sp. 1A ; Sp. 3B ; Sp. 5C ; Sp. 6D ; Sp. 2
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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我有一个newick格式的猫家族的发展史，当我试图在文件中阅读时，我会得到以下错误：
phy<-read.tree("phylogeny.txt")在if (sum(obj[i]$edge，1 ==Geoffroy‘s cat_003，Kodkod_003))，(安第斯山脉cat_1，(Margay_022，Kodkod_003))，(Bobcat_004，(加拿大)，(欧亚lynx_3，伊比利亚lynx_2))，(大理石cat_005，(海湾cat_2，亚洲金色cat_8)，((cat_2，亚
浏览 5修改于2016-05-17得票数 0
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我从Java开始，我做了一些(很多)的工作。我解释我的问题，我有一个平面文件，我通过Java阅读。目标是创建多个输出文件(每个订单一个文件)。我的代码工作，但我并不是来做两件事对我来说是必要的：
if (i % 2 == 0) {}
我列出了
浏览 2修改于2016-09-07得票数 0
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4回答
大约一周前，我问了一个问题来帮助我回答这个问题。
package permutation;
int n = DEFAULT; n = Integer.parseInt(ar
浏览 2修改于2017-05-23得票数 1
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我正在使用Java2Python包将一个Java2Python转换为Python，并且我遇到了一个错误。[root@localhost Desktop]# j2py ConfigurationManager.java ConfigurationManager.py except (IOError, ), exc:
浏览 1修改于2018-05-16得票数 0
我在Java中要做的是使用一个2d数组的python函数。我想取两个值，并在数组的开头插入它们，而不是替换已经存在的值，我只想按下它们。我能用Java实现这一点的方法是什么？python中的示例print numsprint nums
(1,2),(3,4),(5,6)
耽误您时间，实在对不起。
浏览 3修改于2015-05-16得票数 2
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我是一个全新的Java新手，我的第一个任务是实现一个"for“循环。我用C++编写了这个程序，它可以用Java语言编译，但我在运行时得到了一个错误。有人能告诉我出了什么问题吗？import java.util.Scanner;{
{
Vector<Integer> primefactors = new
浏览 0修改于2012-11-17得票数 0
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我试图使用Selenium和java一起在上自动化一些进程。WHenever i按下signin按钮，它会显示一个captcha来选择像这样的图像。为了解决这个问题，我读了大约2页，他们要的是站点密钥，有人能帮我获取的站点密钥吗？ System.setProperty("webdriver.chrome.driver", "chromedriver.exe");
ChromeDriversecure.
浏览 0修改于2019-09-16得票数 0
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