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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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Develop |- Commit 2 |- Merged pull request #1 from user/branch/name
2&3在发展史上出现的原因
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。Sp. 3B ; Sp. 5C ; Sp. 6我想要输出什么(虚构的值；每个索引出现一次，并计算所有相关物种的系统发育距离)：A ; 7
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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setText(xa.getValueAt(4, 0).toString()); s7.setText(xa.getValueAt(6, 0).toString());
s8.setText(xa.getValueAt(7, 0).toString());: 7 >= 7错误。Exception in thread "AWT-EventQueue-0" j
浏览 12修改于2017-11-27得票数 0
在迁移到Java 7之后，遗留的Java 5应用程序现在会抛出异常。我在Java类中使用这段代码来返回URL。URL可以是文件路径，也可以是应用程序的代码库。当URL是文件路径时，会引发错误。它在Java 5中运行得很好。
浏览 3修改于2014-04-03得票数 1
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我正在使用java 7 AsynchronousSocketChannel编写一个简单的客户端服务器应用程序。
浏览 7提问于2013-12-21得票数 0
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我正在开发一个带有本机可执行文件的跨平台Java应用程序。对于Mac，我使用作为一个蚂蚁任务来创建App。
现在Oracle发布了Java7和它自己的ANT任务"“，我遇到了一个问题。使用本地Mac和Jarbundler只适用于Apple 6，而使用Oracle只适用于Java 7。我非常了解这方面的背景，，但我想知道是否有一个既适用于Java6，也适用于Java7的JavaApplicationStub。它现在既支持Apple 6和Orac
浏览 5修改于2017-05-23得票数 5
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我计划学习Java，我有其他面向对象语言的编程经验，所以我熟悉OOP的概念。目前，我正在考虑两本书来帮助我快速开始Java开发。"Head first For第二版“或"Java All-in-One For Dummies第三版”。
现在很多人推荐Head first into Java作为这两本书中对我来说更好的一本。然而，Head first into Java是在2005年出版的(除非他们有更新的版本，我不知道)，并且用Java5授课。Java</em
浏览 2提问于2012-07-05得票数 0
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我正在学习一本书“-with”一门课程--即使用Java5.0 (1.5)，而我的机器有Java7版本(1.7.0_65)，这会不会导致我的语法头痛或以任何方式减缓我的速度？提前谢谢。
浏览 4提问于2014-11-10得票数 0
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$ cassandra 好吧，init脚本的那一部分是怎么回事？java_ver_output=`"${JAVA:-java}" -version 2>&1`
jvmver=`echo "$java_ver_output" | awk -F'"' 'NR==1 {7 or la
浏览 4修改于2014-06-12得票数 2
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我正在通过JNI使用C++库开发一个图像处理Java7u80应用程序。Java 7u80 Overall duration: **29'581 [ms]**
在我的例子中，Java 7比Java 8快17% (相同的代码，代码级resp
浏览 0修改于2015-10-09得票数 12
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