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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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Develop |- Commit 2 |- Merged pull request #1 from user/branch/name
2&3在发展史上出现的原因
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。Sp. 2A ; Sp. 4B ; Sp. 1
C ; Sp. 6
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
我有一个newick格式的猫家族的发展史，当我试图在文件中阅读时，我会得到以下错误：
phy<-read.tree("phylogeny.txt")在if (sum(obj[i]$edge，1 ==clouded Leopard_036)，((Serval_001，(Caracal_020，非洲黄金cat_002))，((Pampas cat_3，(TigrinaCA_13，TigrinaSA_6，20，(黑脚cat_0006，沙cat_8，(欧洲野生cat_007，国内的cat_4804)，(非洲野生cat_0004，中国沙漠c
浏览 5修改于2016-05-17得票数 0
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我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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我的应用程序应该运行的目标系统使用Java 6。在我的开发机器上，我有Java 7。我可以不下载Java 6来进行开发吗？我在上找到了一个交叉编译的例子：
javac -source 1.6 -target 1.6 -bootclasspath C:\jdk1.6.0\lib\rt.jar -extdirs "" OldCode.java然而，这也要求存在一个属于Java6的rt.jar，还有更简单的方法吗？
浏览 0提问于2015-12-21得票数 1
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2回答
接着是debian Java Sun wiki，然后是1打开jsk 7，它有关于安装6:链接到debian上的java 7的说明再一次打开终端，又输入了make，但得到了错误，没有生成！我该怎么做？如何安装
浏览 0修改于2018-11-25得票数 1
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使用GWT框架、Spring框架、Play框架、Seam框架为Java创建了MVC风格的框架。
是否真的需要一个框架？如果没有，是否有一个图表将显示等效的Java 6框架？
浏览 2修改于2017-05-23得票数 3
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在CentOS 6 x32中安装Java 6有问题。但它会产生以下错误：java.util.zip.ZipException(ZipInputStream.java:386)
at java.util.
浏览 0修改于2012-08-21得票数 1
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我有Java6SE，Tomcat 6，Eclipse为J2EE，用于JS启动和工作。有时，我需要java库的源代码和文档，我相信它在EE工具包中。这是否就像在Vista 64位上运行Java6EE安装包一样简单？
如果我有下载，有办法提取文件并手动放置吗？
浏览 0提问于2010-08-14得票数 2
我正在开发一个带有本机可执行文件的跨平台Java应用程序。对于Mac，我使用作为一个蚂蚁任务来创建App。
现在Oracle发布了Java7和它自己的ANT任务"“，我遇到了一个问题。使用本地Mac和Jarbundler只适用于Apple 6，而使用Oracle只适用于Java 7。我非常了解这方面的背景，，但我想知道是否有一个既适用于Java6，也适用于Java7的JavaApplicationStub。它现在既支持Apple 6和Orac
浏览 5修改于2017-05-23得票数 5
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我们有一个使用Netbeans 6.7.1和Glassfish v2.1开发的Java 5项目。Java 6向后兼容Java 5吗？
浏览 0修改于2011-04-12得票数 2
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目前我在Windows 7上运行java 7java version "1.7.0"Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 21.0-b17, mixed mode)
如何将其替换为Java 6 ?？
浏览 0提问于2012-05-16得票数 1
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