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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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Develop |- Commit 2 |- Merged pull request #1 from user/branch/name
2&3在发展史上出现的原因
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。Sp. 1D ; Sp. 7D ; Sp. 8
D ; Sp. 9
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
我们正在将现有的应用程序从Java 7转换为Java 9，为了满足最低要求，我在这里尝试遵循这个页面：Caused by: org.apache.maven.surefire.booter.SurefireBooterForkExceptionCommand was cmd.exe /X /C ""C:\Program Files\Java\jdk-9.0.1\bin\java" --add-
浏览 6修改于2019-04-23得票数 4
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我有一个关于带整数和字符串的java算术的问题。+ c + " = " + a + b + c);以上代码分别输出"45 = 18“、"9= 135”和"9 = 45“。我的第一反应是他们都输出了"9 = 9“。我希望有人能帮我理解这次行动。我很感激你的帮助！
浏览 0提问于2019-03-20得票数 1
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我正在尝试学习java9的新模块特性，我不认为我在做需要/导出的事情，因为除非我在project structure窗口中添加依赖项，否则intelliJ会在我的导入中给我红色文本，我非常确定这样做是错误的下面是我的文件结构--src ------main.java --src ----module-info.java<
浏览 2修改于2018-03-25得票数 1
为了测试一个项目是否为java9做好了准备，我花了几个小时尝试让eclipse编译完整的项目。顺便说一句，我正在虚拟机中使用XUbuntu ...我安装了最新的openjdk-9-*包，并删除了所有java8包。
我下载了eclipse oxygen的eclipse安装程序，并安装了eclipse for Java SE的默认版本。(java.base@9-internal/JrtFileSystemProvider.java</e
浏览 81修改于2018-02-27得票数 2
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java 9模块中最酷的特性之一是能够准备一个非常优化的JRE+modules包，在这个过程中可以应用几种优化技术。虽然还没有实现，但HotSpot团队正在计划在此阶段进行AOT编译。对于这个链接阶段，OpenJ9的“诀窍”和优化是什么？
浏览 2提问于2017-10-17得票数 1
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我想开始使用Java 9和10，但是当我用下面的代码创建一个简单的类时：import java.util.Map;
List list1 = List.of();在Eclipse中，我在安装的jre中安装了JRE10，编译器的遵从性级别是10 (我也尝试过9</
浏览 27修改于2018-06-17得票数 -3
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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我在Java 9中使用了jetty 9.4.8.v20171121，这是我加载的jetty模块列表：jetty-servlet-9.4.8(BuiltinClassLoader.java:582) at java</em
浏览 0修改于2018-02-07得票数 3
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