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我的系统发展史来自一份出版物，是BEAST的共识树，众所周知，BEAST引入了非正分支长度。我已经检查了"-“和"0”的系统发展史，它应该揭示非正的分支长度，并发现了一个零长度的分支，我将其更改为0.0000001。然而，这似乎并没有解决我的问题。是否有一个功能来检查给定的系统发展史，例如检查这样的分支长度并改变它们，检查单例，等等。树是完全分叉的，所以我不需要再次检查。
浏览 76提问于2019-11-15得票数 0
在发展史上对此很好奇...带有数组索引的方括号({0}、{1}等)是如何成为字符串格式的标准的？
有什么特别的意义吗，或者是80年代有人在半空中挑出的东西？
浏览 1修改于2012-09-22得票数 4
我正在尝试创建一个系统发展史，其中我编码的分支长度是用颜色而不是长度表示的。所以我希望分支长度相等。
浏览 2修改于2018-06-22得票数 2
我想在存储为multiPhylo对象的多个系统发展史中运行相同的函数。
例如，假设我有1,000棵树的multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。
浏览 23提问于2018-01-04得票数 1
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Develop |- Commit 2 |- Merged pull request #1 from user/branch/name
2&3在发展史上出现的原因
浏览 0修改于2020-01-13得票数 0
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我正在使用语言发展史在R中绘制一些情节。我想在系统发育图的末端节点之后画一排方块，并给它们着色，以表示一些变量。
我已经创建了方块，但是我在按正确的顺序给它们着色时遇到了问题。
浏览 0提问于2014-10-23得票数 1
我有一个csv文件，其中包含数百个物种的物种名称，顺序与它们在我的系统发展史中的$tip.labels中出现的顺序相同。
浏览 25修改于2019-08-19得票数 1
我正在浏览维基百科上的Unix和类Unix系统的发展史，其中一个操作系统的名字对我来说很突出: OpenServer。
浏览 0修改于2013-05-07得票数 4
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我有一个newick格式的猫家族的发展史，当我试图在文件中阅读时，我会得到以下错误：
phy<-read.tree("phylogeny.txt")在if (sum(obj[i]$edge，1 ==cat_1，(Margay_022，Kodkod_003))，(Bobcat_004，(加拿大)，(欧亚lynx_3，伊比利亚lynx_2))，(大理石cat_005，(海湾cat_2，亚洲金色cat_8)，((cat_2，亚洲金cat_8)，((丛林cat_20，(黑脚cat_0006，沙cat_8
浏览 5修改于2016-05-17得票数 0
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我正在使用一个unix shell脚本，它可以构建基因组，然后创建一个系统发展史。根据您使用的基因组组装器，最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同基因组组装器的效果。
浏览 3修改于2015-02-27得票数 3
我需要为每个列值提取或修剪系统发展史(从系统学中)，然后计算索引列的每个值的系统发育距离。我的数据集中有许多索引值，因此手动执行此操作是不切实际的。Sp. 5C ; Sp. 6D ; Sp. 2
D ; Sp. 8
浏览 19修改于2019-11-08得票数 0
特别是，它们的结构倾向于概括发展过程的发展史。有时，我认为自己在用代码中的懒惰来换取测试中的懒惰。
这是一个多大的问题？谁在这里不断地重构和重组他们的单元测试，试图改善他们的整体结构？
浏览 0修改于2017-05-23得票数 25
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java.lang.IllegalArgumentException: Class file is Java 8 but max supported is Java 7: org/eclipse/jettyapache/jsp/JettyJasperInitializer$1.class in C:\Users\Tony\.m2\repository\com\google\appengine\appengine-java-sdk\1.9.48\appengine-<
浏览 5提问于2016-12-22得票数 2
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我喜欢DSL，但是我对Java 8知识的缺乏阻碍了我的工作。例如，如何用Java7编写下面的示例代码，我对e -> e.id("sendMailEndpoint"))感到困惑，因为我不知道e是什么类型！
浏览 3修改于2015-02-19得票数 1
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我一直在debian中安装java 8，如下所示：
echo "deb-src http://ppa.l
浏览 1提问于2019-04-24得票数 3
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这是java代码的长版本： return Optional.of(new Foo()); return Optional.empty();有没有办法使用java 8的可选库将其压缩成一行呢？
浏览 1修改于2016-05-20得票数 2
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我正在我的Linux机器(Ubuntu14.04 (Trusty ))上安装Java 8。我做了两件事：add-apt-repository ppa:openjdk-r/ppaapt-get install openjdk-8-jre
但是，同样，当我运行java -version时，
浏览 0修改于2018-02-07得票数 3
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13/11/2019 11:05:12我的数据库是postgresql，我的字段是timestamp类型的
在java类中，我的字段注释如下
浏览 9提问于2019-11-13得票数 1
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code goes here在调用端，方法doSomething()将被调用如下-我检查了Java8文档中的String/Integer/Object等，但是没有找到实现Predicate<T>接口的任何类。我不知道在我的Java 8教程系列中错过了什么，但是我无法得到这样的现象：
上述两种情况的
浏览 0修改于2018-07-08得票数 2
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