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www.w3.org/1999/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/1999/XMLSchema" xmlns:r="http://www.reactome.orgschemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/
浏览 1提问于2011-02-11得票数 0
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我正在尝试将Reactome数据库加载到我的Neo4j桌面中。我从Reactome网站()下载了数据库的最新版本，Neo4j桌面的版本是1.3.4，对于创建的数据库，我使用的是Neo4j 4.1.1 (也尝试了4.1.0 )。之后，我提取了tar.gz文件，并使用Neo4j桌面中的终端来通过以下命令恢复数据库中的数据：
bin/neo4j-admin restore --from=/PATH/reactome.graphdb
浏览 9提问于2020-09-02得票数 1
我正在尝试将reactome DB安装到Neo4j中，这样我就可以从它制作一个图形。不管我的语法如何，我总是得到相同的错误信息。DB文件夹存储在neo4J\bin\reactome中。我基本上一直在使用这个cypher命令和它的各种排列：
neo4j-admin restore --from=neo4j\bin\reactome --database= reactome.graphdbInvalid input 'e': expected <init> (line 1, column 1 (
浏览 12修改于2018-09-27得票数 1
curl -H "Content-Type: text/plain" -d "$(printf '#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B')" -X POST --url https://reactome.org/projection/ String $notifyMsg="\"$(printf '#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B')\"";
浏览 0提问于2018-01-28得票数 0
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,url:https://reactome.org/PathwayBrowser/#/R-HSA-72706,sameAs:null,version:62,keywords:[Pathway],creator:[],includedInDataCatalog:{url:https://reactome.org,name:Reactome,@type:DataCatalog},distribution:[{contentUrl:https://r
浏览 0修改于2018-07-19得票数 2
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"KEGG Pathway", "KEGG Pathway", "ReactomeGene Sets", "Reactome Gene Sets", "Reactome Gene Sets",
"Reactome<
浏览 10修改于2021-09-03得票数 0
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KEGGv1=c(286,124,289,0,0,244,135,0,121,124,148,0,101,271,87,0,0),melted$cat <- ''m
浏览 5修改于2017-11-21得票数 3
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我对Cytoscape Reactome FI插件的使用比较陌生。我已经用DESeq分析确定了我感兴趣的两种实验条件下小鼠(小鼠)差异表达的基因。我希望找出在这些差异表达的基因中丰富的途径。我偶然发现了Cytoscape的Reactome FI插件，它可以找到与癌症和其他类型的疾病相关的路径和网络模式。可以将小鼠的基因输入到反应组中以识别丰富的途径吗？
浏览 16提问于2020-04-09得票数 0
我正在通过以下命令创建一个文件：awk '{print $2 " "$7" "$8}' REACTOME_EXTENSION_OF_TELOMERES.xls | awk '$8!REACTOME_E
浏览 0修改于2019-04-22得票数 0
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(1,2,3),"count" = c(10,20,30),geneRatio=c(0.5,0.8,0.2),我使用ggplot库绘制了一个点图：
ggplot(data = d,aes(geneRatio,name,size=count,colour = pvalue))
浏览 1修改于2017-07-10得票数 1
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protein(Sample, Reactome_Id, State):- %used to generate uniprot idsprotein_stack(Sample, Reactome_Id, State):- p
浏览 4修改于2014-06-12得票数 1
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MORF4L1 ABHD16A ZNF274 C7orf43 SNX33REACTOME_SIGNALING_BY_NOTCH1如何将该文件拆分为4个文件(我的原始文件有39行)，这样我就可以得到4个文件，每个文件都由一行中的第一个单词命名: GGTAACC_MIR4095P.txt GCM_TINF2.txt chr9q34.txt REACTOME_SIGNALING_BY_NOTCH1
浏览 0修改于2019-04-12得票数 0
PathwayBrowser/#/R-HSA-109582 Hemostasis TAS Homo sapiens3 A0A075B6P5 R-HSA-1280218 https://reactome.orgPathway
浏览 2修改于2021-05-24得票数 0
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dput(Int)
"GO", "GO", "GO","GO", "Reactome", "GO", "Reactome"
浏览 20提问于2020-11-24得票数 1
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-2 - Chemical synthesis (Chemical synthesis))reactome0328 Chemical synthesis (Chemical synthesisreactomeuniprotkb Q92843(proteinchebi
浏览 1修改于2020-02-03得票数 1
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stringr::str_trunc(x, 40, "right"))
我尝试截断scale_x_discrete标签以缩短标签，但我想删除每个标签前面的"REACTOME
浏览 7修改于2021-11-10得票数 0
goslim_plantsynonym: "protein amino acid binding" EXACT []xref: reactome:R-HSA-170846 "TGFBR2recruits TGFBR1"
浏览 0提问于2019-03-17得票数 3
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7.00E-42 T 01.02.19 IPR011344 Single-stranded DNA-binding protein GO:0003697|GO:0006260 Reactome119 7.00E-42 T 01.02.19 IPR000424 Primosome PriB/single-strand DNA-binding GO:0003697 Reactome
浏览 0提问于2019-02-01得票数 0
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