不成功地将Reactome数据库加载到Neo4j

Question

我正在尝试将Reactome数据库加载到我的Neo4j桌面中。

我从Reactome网站(https://reactome.org/dev/graph-database#GetStarted)下载了数据库的最新版本，Neo4j桌面的版本是1.3.4，对于创建的数据库，我使用的是Neo4j 4.1.1 (也尝试了4.1.0 )。

之后，我提取了tar.gz文件，并使用Neo4j桌面中的终端来通过以下命令恢复数据库中的数据：

bin/neo4j-admin restore --from=/PATH/reactome.graphdb/graph.db --database=graph.db

然后按下开始按钮。Start是成功的，所以我在Neo4J浏览器中打开了它--这里附带了通知：

数据库“neo4j”不可用。运行:sysinfo获得更多信息。

我检查了debug.log:问题应该在neo4j.conf文件debug.log -截图中的禁用升级选项中

因此，我取消了以下选项：dbms.allow_upgrade=true

但是，当我尝试使用Start按钮运行dataset时，我只得到了通知：

数据库启动失败: DB数据库-e25f8ba8-dea1-4e70-8944-024f73a2eeaf 'v4.1.1‘退出状态为“已被杀死”。检查日志

在查看日志之后，我发现了以下内容：neo4j.log -打印机

我现在真的很累了。有没有人知道如何处理这个问题？非常感谢!

Answer 1

您可能希望在reactome.graphdb.dump文件中使用以下脚本：

bin/neo4j-admin load --from=/PATH/reactome.graphdb.dump --database=reactome --force