我对Cytoscape Reactome FI插件的使用比较陌生。我已经用DESeq分析确定了我感兴趣的两种实验条件下小鼠(小鼠)差异表达的基因。我希望找出在这些差异表达的基因中丰富的途径。我偶然发现了Cytoscape的Reactome FI插件,它可以找到与癌症和其他类型的疾病相关的路径和网络模式。可以将小鼠的基因输入到反应组中以识别丰富的途径吗?
发布于 2020-04-09 22:13:46
我不确定,但我相信Reactome的FI网络是人类的。但是,您可以使用stringApp做您想做的事情,它还包括对许多物种执行丰富操作的能力,包括鼠标。
--滑板车
https://stackoverflow.com/questions/61109486
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