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回答
yaml.dump似乎将两个破折号添加到第一个键下的第二行
_13_2.
fastq
- Unmap_12_1.
fastq
- Unmap_34_2.
fastq
_07_1.
fastq
- Unmap_28_1.
fastq
- Unmap_24_1.
fastq
_02_
浏览 17
修改于2019-11-25
得票数 2
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1
回答
解压缩,然后在linux中处理
fastq
.gz 14624_1#7_1.
fastq
.gz14624_1#11_1.
fastq
.gz 14624_1#2_1.
fastq
.gz 14624_1#5_1.
fastq
.gz 14624_1#8_1.
fastq
.gz.<
浏览 23
修改于2017-03-02
得票数 0
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2
回答
使用for循环在多个文件上运行zcat
:BB001.
fastq
BB013.
fastq
.gz IN014.
fastq
.gz RV006.
fastq
.gz SL083.
fastq
.gzBB003.
fastq
.gz BB015.
fastq</
浏览 0
修改于2014-10-14
得票数 3
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1
回答
在使用glob的for循环中指定'./‘有什么好处吗?
我的印象是,在搜索以.
fastq
结尾的文件时使用D1可能更安全。例如,./将阻止捕获文件.
fastq
。这显然是错误的,如下例所示:mkdir -p ${TMP_DIR} touch {a,b,c,}.
fastq
"# with ./:" echo "${f}") rm -rf ${TMP_D
浏览 0
修改于2019-02-25
得票数 10
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1
回答
gawk根据第二列的一部分创建第一列
我所拥有的:
fastq
/D0206.L001_R1_001.
fastq
fastq
/D0206.L001_R2_001.
fastq
fastq
/D0208.L001_R1_001.
fastq
fastq
/D0208
浏览 2
提问于2016-04-27
得票数 1
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1
回答
Snakemake问题:用空格分隔符将所有文件合并在一起,而不是迭代它
view -bS -F 4 - | samtools sort -o
fastq
_minon/sample01.bam 类似地,我有多个示例(参考文件夹中的
fastq
/sample01.
fastq
)/sample02.
fastq
fastq
/sample03.
fastq
fastq
/sample01.
fastq
| samtools view -bS -F 4 - | samtools sort-o <
浏览 2
提问于2020-05-05
得票数 0
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1
回答
在文件夹上使用类似名称的
fastq
文件,并将它们输入到脚本中(对对)
NAM3_PI648600_R2.
fastq
.gz NAM7_Glenlea_R1.
fastq
.gz PI648598_R2.
fastq
.gz NAM11_BW415_R2.
fastq
.gzNAM13_Frontana_R1.
fastq
.gz NAM17_AC_Barrie_R2.
fastq
.gz NAM3_PI648842_R1.
fastq
.gz NAM7_Glenlea_R2.
fastq
.gzPI648611_R1.
fastq<
浏览 0
提问于2019-07-12
得票数 1
3
回答
为行中的每个唯一值连接列中的所有元素。
如:cat SRR3493476_1.
fastq
SRR3493477_1.
fastq
SRR3493475_1.
fastq
> L1-A_1.
fastq
Run_s Sam_1 fast1_2.
fastq
SRR3493483
浏览 3
提问于2017-10-12
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2
回答
基于AWK中的变量创建csv文件
我想要做的是创建一个用逗号分隔的csv文件,使用提供的
fastq
_1 M1、
fastq
_2 M2和变量列表中
fastq
的名称作为信息。
fastq
folder S1_2.
fastq
.gzS2_2.
fastq
.gz S3_2.
fastq
.gzS4_2.
fastq
.g
浏览 5
修改于2022-01-29
得票数 -1
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1
回答
创建包含带有路径的文件名的列表
例如:我想要创建两个列表,第一个列表具有带路径的所有_1.
fastq
.gz文件名,另一个具有带有路径的_2.
fastq
.gz目录结构是INPUT DIR > 540_C >
FASTQ
> 540_Ct_1.
fastq
浏览 0
提问于2014-12-02
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1
回答
循环遍历目录跳过文件中的文件。
{3-23*01.
fastq
, 3-23D*01.
fastq
,3-23*02.
fastq
,3-23*03.
fastq
,3-23*04.
fastq
,3-23D*01.
fastq
,3-30*01.
fastq
3-30-3*01.
fastq
,3-30*02.
fastq
,3-30-3*02.
fastq
,3-30*03.
fastq
,3-30-3*03.
fastq
} 但是,由于某种原因,当我像下
浏览 3
修改于2015-06-28
得票数 1
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1
回答
如何在循环中不使用do命令两次执行命令
这些是我的档案KIMS2021-02_R1.
fastq
.gz_1.
fastq<
浏览 2
提问于2021-12-20
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2
回答
在linux中创建该列并将第二列的文件重命名为新列?
示例数据:SRR7015874_1.
fastq
SRR7015875_1.
fastq
SRR7015876SRR_2.
fastq
SRR7015875_2.
fastq
SRR_4.
fastq
SRR7015876_1.
fastq
SRR_5.<
浏览 4
修改于2022-03-30
得票数 1
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1
回答
而循环错误:接近意外令牌的语法错误“已完成”
echo "
FASTQ
file 111 ID: $ID_111" echo "
FASTQ
file 112: $
fastq
echo "<
浏览 2
修改于2016-07-05
得票数 1
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2
回答
按顺序连接文件Linux命令
我的目录中有以下文件:L002_R2_001.
fastq
L005_R2_001.
fastq
L004_R2_001.
fastq
L002_R1_001.
fastq
L005_如果我手动完成
浏览 3
修改于2015-03-20
得票数 2
2
回答
使用正则表达式的Makefile模式规则
我需要转换一堆名称如下的文件:bar_S4_R2_001.
fastq
.gzbar_R1_001.
fastq
.gz touch bar_S4_R2_001.
fastq
.gztouch foo_S13_R1_
浏览 0
提问于2019-02-28
得票数 0
3
回答
如何根据定界符前的值对R中的向量元素排序
myvec <- c("2-1_16S_S217_R1_001.
fastq
", "2-2_16S_S226_R1_001.
fastq
", "3-1_16S_S234_R1_001.
fastq
", "3-2_16S_S242_R1_001.
fastq
", "11-1_16S_S199_R1_001.
fastq
", "1-1_16S_S197_R1_001.
fastq
&quo
浏览 1
修改于2019-02-12
得票数 2
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1
回答
使用sed从文本文件中删除特定的字符串,不更改输出文件?
_R2.
fastq
.gzSRR10598049_R2.
fastq
.gz SRR10598164_R1.
fastq
.gz SRR8916418_R2.
fastq
.gz SRR10598050_R1.
fastq
.gz SRR10598164_R2.
fastq
.gzSRR8916419_R
浏览 0
修改于2023-05-23
得票数 2
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1
回答
如何连接文件并根据另一个文件的匹配给输出提供另一个名称?
我有一个目录data,其中有几个fastqs,如下所示:SRR13456784_2.
fastq
SRR13456785_2.
fastq
SRR13456786_2.
fastq
SRR1987
浏览 0
修改于2023-04-27
得票数 2
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1
回答
makefile -命令在第一个目标之前开始
merged_026_ATGTCA.
fastq
> Cut_merged_026_ATGTCA.
fastq
#cutadapt -a TGGAATTCTCGGGTGCCAAGGAACTCCAGTCACATCACGATCTCGTATGCCGT
浏览 3
提问于2015-07-08
得票数 0
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第 7 页
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