gawk根据第二列的一部分创建第一列

Question

我有一个2列tsv，我需要使用第2列中的部分值插入一个新的第一列。

我所拥有的：

fastq/D0110.L001_R1_001.fastq  fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
fastq/D0206.L001_R1_001.fastq  fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
fastq/D0208.L001_R1_001.fastq  fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

我想要的：

D0110    fastq/D0110.L001_R1_001.fastq  fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
D0206    fastq/D0206.L001_R1_001.fastq  fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
D0208    fastq/D0208.L001_R1_001.fastq  fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

我想把"fastq/“和第一个句号之间的所有东西都打印出来，作为新的第一栏。

Answer 1

$ awk -F'[/.]' '{printf "%s\t%s\n",$2,$0}' file
D0110   fastq/D0110.L001_R1_001.fastq   fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
D0206   fastq/D0206.L001_R1_001.fastq   fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
D0208   fastq/D0208.L001_R1_001.fastq   fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

它是如何工作的

awk在所有输入行上隐式循环。

• -F'[/.]' 这告诉awk使用任何出现的/或.作为字段分隔符。这意味着，对于您的输入，您要查找的字符串将是第二个字段。
• printf "%s\t%s\n",$2,$0 这告诉awk打印第二个字段($2)，后面是制表符(\t)，后面是输入行($0)，后面是换行符(\n)。