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按照OpenBSD网站上的虚拟化指南，我运行了# rcctl enable vmd (似乎已经成功完成)，然后运行了# rcctl start vmd (返回vmd(failed) )。
浏览 0提问于2021-04-19得票数 2
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总的来说，我对VMD和编程非常陌生。我需要将两个子单元的pdb文件合并成两个子单元的组合pdb和psf文件。我使用了Namd教程，使用了两个名为BChain270VerCTrue.pdb和barn_noH2o_ChainD.pdb的pdb文件，并在VMD中运行了这个pgn：
这就是代码所显示的内容：
浏览 8修改于2021-10-21得票数 1
我在ubuntu15.10中安装了gromacs和vmd，它们工作得很好。但是，在我升级到ubuntu14.04之后，我无法再次安装它们，vmd不可能被提取。$ tar -zxvf vmd-1.9.2.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz
tar:
浏览 0修改于2016-05-08得票数 0
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在VMD中，我希望用绘图方法CPK加载每个新文件。由于一些技术原因，这在.vmdrc文件中似乎不是一个选项。
我如何通过VMD命令行(以便我可以创建一个脚本)来完成这个任务？
浏览 8提问于2017-02-13得票数 4
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我一直在尝试在支持python的Macbook上安装VMD1.9.2，但未能成功。在我看来，用于VMD的打包的.dmg文件没有Python支持。我使用命令PythonPython来查找我的VMD安装时所使用的选项，而MACOSXX86 FLTKOPENGL FLTK TK ACTC CUDA IMD LIBSBALL LIBTACHYON VRPN
浏览 10修改于2015-08-22得票数 1
如何在VMD文本模式(vmd shell)中激活命令历史记录或自动完成我在Linux Ubuntu中使用它，当我使用箭头键时，它会打印出像^[[A这样的字符。
浏览 22提问于2017-08-30得票数 2
我一直试图在我的32位15.04安装上安装VMD (如果有帮助的话，这里是PDF格式的安装指南：http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/current/ig.pdf)。
浏览 0修改于2015-05-16得票数 5
我让vmd在我的Lubuntu64位上工作，但是当我尝试运行它时，突然出现了错误。我试过重新安装它，但没有喜悦。没有匹配的。我已经完全移除了vmd，看看这是否有帮助。我尝试了它提出的建议(很抱歉，我不记得细节，但它是抱怨的数据自动化系统和我的图形司机一段时间。
我没有更新它什么的。
浏览 0修改于2012-11-23得票数 1
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问: vmm/vmd/vmctl可以用于非文本虚拟机吗？
我的问题是它能不能？如果是，怎么做？
浏览 0提问于2019-10-20得票数 2
我有一个代码可以做到这一点，但是我的个人和工作计算机没有足够的计算能力来完全执行程序，而不会使我运行它的程序崩溃(VMD-视觉分子动力学)。代码是为VMD扩展TK控制台编写的。有没有办法可以使用perl来执行我的tk控制台代码？center $index2]]]" $index2 delete}
这将对加载到VMD
浏览 5提问于2015-02-17得票数 2
我在VMD Tkconsole (VMD版本: 1.9.2)中放入以下代码：
catdcd -o output.dcd -i indexFile.ind input1.dcd input2.dcd input3
浏览 10修改于2016-08-31得票数 2
如何在vmd中打开psf文件，然后仅使用行命令加载此psf文件的多个帧(dcd文件)？我有上百个dcd文件，我不想手动这样做。
浏览 23提问于2015-08-11得票数 1
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我是tcl编程的新手，我需要为vmd编写一个脚本，它计算两个原子对之间的两个距离，并将它们打印在一个输出文件中。我不明白为什么措施不能采取atom_1等。这是我的脚本，谢谢您的帮助。
浏览 4提问于2020-06-09得票数 0
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目前，我有: pbc box -color黑-width 1 pbc set {4.541 4.541 6.463 69.5 69.5 90} 我怎么才能再做一个呢？
浏览 82提问于2019-02-18得票数 1
我已经在这台新机器上安装了vmd。当我输入以下命令时，vmd加载时没有任何分子：这个*.gro文件包含一个蛋白质分子。通过vmd发射分子是行不通的。我试着用谷歌搜索这个问题，但我找不到正确的答案。有没有人有同样的问题，并能够解决它？
浏览 5提问于2017-04-08得票数 1
我试图使用atomselect命令删除.gro文件中蛋白质区域内的脂质。因为它是一个马提尼粗粒度文件，所以我只可以使用关键字resname作为剩余名，name或type用于珠类型(我的伪原子)。因此，没有定义默认的单字。atomselect 0 "all not resname DPPE DOPE POPE POPG within 1 of resname ALA ARG ASN ASP CYS GLN GLU GLY HIS ILE LEU LYS MET PHE PRO SER THR TRP TYR VAL"
浏览 1修改于2020-06-20得票数 0
我下载了一个扩展名为"VMD“的数据库文件。现在我正在寻找一个windows软件，它可以打开这个文件，这样我就可以看到所有包含的表(稍后)导出其中的一些信息csv。
浏览 0修改于2014-02-04得票数 5
我正在尝试从Android应用程序中做一个简单的插入。我可以通过连接php从浏览器运行?entry="Sample value from browser"脚本，但是当我在Android上运行应用程序时，就没有插入了。package us.jtaylorok.android.sqlite.first;
import org.apache.http.NameValuePair
浏览 1修改于2013-12-22得票数 5
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