编写Python或TCL VMD脚本

Question

有没有人知道关于编写Python或TCL脚本的完整教程？我想写一个脚本来加载一个分子，使它的3个表示，并改变属性(如着色方法，绘图方法，等值法等)，最后渲染图像。

我看过了这篇教程，但它教给我的所有脚本都是加载一个分子并选择原子。http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd/tutorial-html/node4.html

有没有可以学习编写脚本来执行更高级的vmd操作的资源？

Answer 1

对于Tcl的一般学习，有Tcl Tutorial。对于Python的一般学习，可以使用The Python Tutorial (Python 2 version)。你需要选择你在那里使用的路线。然后，您将有足够的信息来查看VMD documentation并采用自己的方式，前提是您对如何解决问题有一点想象力。你可以在这里问你遇到了什么特定的问题；Stack Overflow是关于帮助解决特定问题，而不是一般的“我从哪里开始这个项目？！”问题。

Answer 2

一种可能是，首先创建表示，更改属性等。然后，完成后，将状态保存到文件中(文件->保存可视化状态...)。以这种方式创建的文件是可以使用普通文本编辑器编辑的脚本。例如，您可以搜索并替换加载的分子文件的名称，以将相同的表示应用于其他分子。还可以在脚本文件的末尾添加渲染命令，例如：

render tachyon rendered_image.tga

编辑文件后，您可以通过文件->加载可视化状态...将其直接加载到VMD中。或者，您可以在启动VMD时加载它：

vmd -e your_edited_visualization_state_file.vmd