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我有一个来自Reactome的sbml模型，您可以从下载它，然后单击sbml。我的代码读取sbml文件，但是如何获得<listOfModifiers>的属性# http://model.caltech.edu/software/libsbml/5.18.0python-ap
浏览 4提问于2021-01-20得票数 2
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您知道如何从SBML模型中生成一个可以在SVG中转换或导出的绘图或图形吗？或者直接从用XML编写的SBML模型生成SVG？
我读过文件，但这对我没有任何帮助。
浏览 21提问于2022-01-11得票数 1
我正在尝试使用SBML包来模拟一些模型。模型似乎运行得很好，但我一直收到这些警告。“模型不包含SBML fbc包信息。cobrapy不支持SBML包'layout‘，未分析信息SBML包'render’，不分析信息”
浏览 57修改于2020-02-08得票数 2
我正在从事模拟生物学模拟核心库()的工作，我们目前正在从中模拟SBML模型。但是，我在模拟SBML模型时遇到了问题，在这种模型中有耦合的间隔和物种速率规则，并且物种在浓度单位中(即物种取决于该区域的值)。具有此属性的模型可以在Suite中找到，其中一个是测试用例。关于这个问题的一系列讨论也可以在sbml讨论google小组上找到。甚至我也在SBSCL中为此创建了一个。
我能得到最好的方法来模拟这类SBML模型吗？
浏览 7提问于2020-07-02得票数 2
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演示sbml文件摘自sbml主。例如，我试过谢谢!<sbml level="2" version="3" xmlns="http://www.sbml.org&#
浏览 5修改于2020-02-09得票数 1
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我对sbml是个新手，我真的很困惑。Product = evaluate_sbml_formula(formula,value_of_reactant)
我阅读了sbml文档，但没有找到它。
浏览 14修改于2020-02-09得票数 1
显示构建的输出：1> C：\Users\maiti\Source\Repos\5月25日\MathML\SBML\lib\bzip2.lib1> C:\Users\maiti\Source\Repos\May 25\MathML\SBML\lib\libsbml.lib1> C：\Users\maiti\Source\Repos\5月25日\MathML\
浏览 4修改于2020-02-09得票数 1
我正在尝试从下面的sbml/xml文件中解析信息
doc <- xmlTreeParse(filename,ignoreBlanks = TRUE)
但我无法通过以下方式恢复节点属性
浏览 29修改于2020-02-11得票数 4
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编辑:有一些可以用来最终登陆SBML planet，但我仍然不知道如何导出到其中的任何一个。
浏览 29修改于2020-02-14得票数 2
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我正在寻找一个工具来将SBML模型转换成Matlab函数。我从SBMLTranslate()中尝试过libSBML函数，但它返回的是Matlab，而不是函数。有人知道这种工具是否存在吗？谢谢
浏览 1修改于2020-02-09得票数 1
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文件：#include "libsbmlsim/libsbmlsim.h" /* * by 4th-order Runge-Kutta Method. myResult *r = simulateSBMLFromFile("sbml.xml
浏览 5提问于2017-09-28得票数 1
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"SBML" { "productGroup": "SBML" { "productGroup": "SBML" {
"produ
浏览 0修改于2016-12-20得票数 1
我的输入如下所示：</sbml>
是否可以强制lxml在父元素(如sbml或listOfSpecies )中只编写一次
浏览 37修改于2020-02-11得票数 17
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> <category title="title"> <sbml title="title" value="SBML_NEWSWIDTHTYPE
浏览 0修改于2012-04-08得票数 1
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><sbml xmlns=^"http://www.sbml.org/sbml/level2/version4^" level=^"2^" version=^"4^"><model metaid=^"_case00001^" id=^"case00001^" name=^"case00001^"></model><&
浏览 3提问于2012-04-24得票数 0
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库在/usr/local/include/sbml中，libsbml.so文件可以在/usr/local/lib中找到SHELL = /bin/shCFLAGS = -Wall -g -D_REENTRANT -DVERSION=\"$(VERSION)\"
浏览 0修改于2017-02-24得票数 0
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在我的机器(macOS)上，libsbml (SBML库)安装在通常的位置，即以及- /usr/local/lib的库文件。fi # Use gsl-config for header and linker argumen
浏览 2修改于2020-02-09得票数 9
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2017-05-04 00:00:00.000 PTP0038SBML00291 2017-04-1100:00:00.000 NC0038SBML00291 2016-12-09 00:00:00.000all
Select '0038SBML00291','2017-04-11 00:
浏览 10修改于2018-09-22得票数 1
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SELECT model.query('declare default element namespace "http://www.sbml.org/sbml/level2";return <result>{data($all_species/@id)}</result>') from
浏览 0提问于2009-12-22得票数 0
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