“错误:架构x86_64的未定义符号”发生在LibSBMLSim(SBML=Systems生物标记语言)中。

Question

我尝试使用LibSBMLSim作为c语言的api。我引用了https://fun.bio.keio.ac.jp/software/libsbmlsim/并同时安装了LibSBML和LibSBMLSim.Then，我创建了如下所示的c文件：

/* Example C, C++ code */
#include "libsbmlsim/libsbmlsim.h"
int main(void) {
  /*
   * Simulate sbml.xml to time=20 with dt=0.1, print_interval=10
   * by 4th-order Runge-Kutta Method.
   */
  myResult *r = simulateSBMLFromFile("sbml.xml", 20, 0.1, 10, 0, MTHD_RUNGE_KUTTA, 0);
  write_csv(r, "result.csv"); /* Export simulation result as CSV file */
  free_myResult(r);           /* Free Result object */
  return 0;
}

并执行了"gcc测试.c -o测试“，但出现了错误。错误消息如下：

Undefined symbols for architecture x86_64:
  "_free_myResult", referenced from:
      _main in test-f56b85.o
  "_simulateSBMLFromFile", referenced from:
      _main in test-f56b85.o
  "_write_csv", referenced from:
      _main in test-f56b85.o
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

我检查了/usr/local/include/libsbmlsim/libsbmlsim.h，那里有指定的free_myResult函数。我试了很多次，但不起作用。请帮帮忙。

Answer 1

我检查了/usr/local/include/libsbmlsim/libsbmlsim.h，那里有指定的free_myResult函数。

这只能证实原型的存在。但是在编译时，您需要知道要使用哪个库来查找这些符号。因此，您需要使用-lsbmlsim与库链接，并可能指定使用-L搜索库的位置和使用-I的头文件的位置--所有这些都在命令行中。

或者，您可以使用Makefile。看看libsbmlsim示例中提供的Makefile。