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简单地说，我的输入数据集(特征)包括不同样本(细胞系)的基因水平(RNA表达水平)。在这个数据集中，我复制了相同的生物样本，这意味着我已经测量了两次(或更多次)相同细胞株或细胞系的RNA表达水平。我包括了所有不同的测量(不同的细胞系，同一细胞系的不同测量等等)。作为不同样本的训练集，为了增加人工神经网络的灵活性，而不是只计算平均值而仅使用(对同一细胞株的不同测量)。
浏览 1修改于2020-04-23得票数 0
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我有n处理和m细胞株，对于每个处理:细胞系对，我运行了一个实验，读数是细胞系对处理的敏感性。现在我需要运行一个验证性实验，我需要选择i处理，对于每个处理，我需要选择j敏感和j不敏感的细胞系(在我的例子中，i = 40和j = 4)。在这个验证性实验中，我在同一个平板上运行处理和细胞系，所以我的目标是最小化细胞系的总数。
我想知道这是否可以转换为R ompr可以解决的术语？
浏览 4修改于2017-01-14得票数 0
意图：有关数据集的示例，请参见所包含的图。细胞系(第1行)和药物与得分(第2行)的标题占据前2行。
从A列的第一种药物开始，Range (“A3”)在我的例子中，你会从C，E，G等列的匹配中看到，这取决于分析了多少细胞系。例如，如果
浏览 1修改于2018-07-09得票数 1
我正在尝试从GEO db下载所有有关实验的条目，这些条目涉及“乳腺癌细胞系时间序列基因表达谱”。这似乎太少了，所以是错误的，因为我们肯定知道已经在乳腺癌细胞系上进行了大量的时间序列实验。我想，我在sql查询中可能在"title“中犯了一个错误。有谁可以帮我？
浏览 0修改于2012-07-04得票数 0
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假设我有一个有两列19行的数据框架(见下文)；左列是细胞系的名称，右边的是基因ZEB1在相应细胞系中的表达。hist(Heiser$ZEB1[1:19], breaks=50, col="grey")
它给出了一个直方图，它的x轴是基因表达量，y轴是细胞在细胞中表达的频率，但是，我想在直方图上的特定位置加上细胞系的名称
浏览 3提问于2014-09-30得票数 3
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Myob_Ind 07 1629 1.825 Myob_Ind 0
我的目标是添加额外的细胞系，比如来自中性粒细胞或脂肪细胞的细胞系，并使用箱形图绘制z得分，但我需要此表单中的数据来完成此操作。基因/细胞系的顺序并不重要，只要它们与各自的z分数相匹配即可。我在使用pd.melt和pd.concat时遇到了问题，这让我无法确定它们的正确使用。
浏览 19提问于2021-02-15得票数 0
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我有一个数据框，里面有列基因，它们所属的染色体区域，测量基因表达的细胞系，以及基因在该细胞系中的表达水平--它看起来基本上是这样的： gene region cell_line expressionClaire 3E Z Claire 1 我想要做的是，对于每个细胞系
浏览 19修改于2020-09-02得票数 3
我有一个表格，列出了不同细胞系中被不同病毒感染的化合物的抗病毒活性，如下所示：1 abc123对于有限数量的组合，这当然可以是“硬编码”的，但我希望考虑到以后添加额外的细胞系、病毒株和浓度的可能性，因此可以动态生成旋转列名。
非常感谢任何关于如何在mySQL中高效地编写代码的建议！
浏览 18提问于2018-08-14得票数 1
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每个数据帧具有基因名称的行索引和细胞系的列索引，表达水平填充每个细胞。这3个数据帧具有相同的对应基因名称和细胞系，我希望找到相应行的三元组之间的相关性(即细胞系如何影响3个数据帧之间每个特定基因的表达)。我如何找到新数据帧中的相关系数，然后使用热图进行可视化？ 谢谢!
浏览 16修改于2020-09-07得票数 0
我试着用这个视频让它工作cell.textLabel?.text = "\(client.objectForKey("firstName")!)"
浏览 2修改于2017-05-23得票数 0
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我用DESeq2软件包进行了差异基因分析，找到了30个下调最多的基因，并用fdr<0.05对细胞系进行了分析。我试图使用pheatmap包创建一个热图，但我无法生成我想要的热图。我想为每个细胞系的前30个基因(共8个)生成一个热图，代码如下：
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = GSM_subset,
浏览 32提问于2021-05-19得票数 0
我正在寻找一个含有"ok“这个词的细胞系，这是我的代码：findValue = Sheets("STOCKS").Range("E:E").Find("ok
浏览 4修改于2018-02-11得票数 3
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18个细胞系分为两组-triple和Pos。基因以列的形式列出，细胞线以行的形式列出。我已经生成了一个数据帧，其中包含wilcoxon测试p值、中位数差异和Triple和Pos之间的折叠变化。我需要一个列，告诉我一个基因的“三重”细胞系的数量>0。也就是说，它应该告诉我一个特定的基因在一个“三重”细胞系中有多少次>0。这是一个有代表性的数据。我如何在R中做到这一点？
浏览 2修改于2014-04-15得票数 0
IE：
我正在尝试做一些像WhatsApp和Facebook聊天联系人列表这样的事情(这些细胞系与文本是一致的)。
浏览 0提问于2014-03-19得票数 0
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这就是我将行添加到我的jTable中的方式，正如您所看到的，我尝试在zainteresowania中使用\n，但是它被忽略了。如何简单地在列表中的每一条记录之后添加新行？ List zainteresowania1 = a.getZainteresowania();
Zainteresowania nazwa = (Zaint
浏览 0提问于2015-04-30得票数 0
使用C# Windows Forms；我环顾四周，最后只得到了一个非常复杂的richtextbox单元格自定义实现。注意:该单元格不得由用户编辑。
浏览 1修改于2013-05-13得票数 14
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2 3.3 BGene_3 1.1 B我有一个数据框，里面有100个不同细胞系的每个细胞系中每个基因的表达都被检查了3次，这就是为什么我们要对重复进行t.test
我想在Gene_X上运行t.test (X=1，2，3，4，5...)在A，B，C型细胞中...我使用以下代码拆分数据
浏览 0修改于2019-09-12得票数 0
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