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我正在尝试绘制一个河图，以显示根据p值，从疾病阶段1到阶段2的路径是如何变得重要的。我想要显示基于相同路径的两个阶段之间的p值的河图的流量宽度。例如，p1和p2是两条通路，随着疾病从1期进展到2期，p1变得越来越重要(p值从0.8变化到0.02)。途径p1在第一阶段有12个突变基因，在第二阶段有9个突变基因。同样，通路p2在阶段1中显著，但在阶段2中不显著。途径p2在第一阶段有10个突变基因，在第二阶段有5个突变基因。此信息显示在下面的数据框中： pathway <- c('p1','p1','p2','p2')
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浏览 45提问于2021-08-24得票数 0
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我正在试着写一个函数，使用列表理解关于开放阅读框架，使用一个只有停止密码子的字典。程序一次接受三个字母，如果这三个字母是停止密码子之一，则程序停止并计算字母数(停止密码子不计算，之后也不计算)。 例如，nextStop2('AAAAAAAGTGGGTGCTAGGTTGGC')应该返回15。这是我到目前为止得到的结果，但是python一直告诉我语法错误。有人能给我一些关于如何改进的建议吗？ def nextStop2(Seq):
GeneticCodeStop = {'TAA':'X', 'TAG':'X'
浏览 20修改于2021-11-09得票数 0
在来自EDX的这视频中，教官将二项式定理解释为：计算(a + b)^n = a^n + C(1)a^{(n-1)b} + C(2)a^{(n-2)b^2} + ... + C(n-1)ab^{(n-1) + b^n}时(a + b)^4 = 1, 4, 6, 4, 1系数(a + b)^n = a^n + (n choose 1) a^{(n-1) b^1} + (n choose 2) a^{(n-2) b^2} + ... + (n choose n-2) a^2 b^{(n-2)
浏览 0修改于2020-08-07得票数 2
我使用的基因表达数据，是浮动数字，并希望训练分类器考虑到二进制分类。由于我是这个领域的新手，我有一些问题：下面是我使用的代码：
from sklearn.model_selection import train_tes
浏览 0修改于2021-07-12得票数 1
当时，我成功地为我需要做的工作编写了模拟代码。然而，我对python还是个新手。因此，我现在正在使模拟更有效率。例如： z = numpy.random.choice(pat)
if random.random() < mut: malejuv[y][x][0] = 1
elif maleadult[z][0] =
浏览 0修改于2017-05-08得票数 0
当查询是"Paleo“时，我想让我的索引不返回”古生物学“的结果。然而，我确实希望它返回与“旧石器”相关的“旧石器”的结果。
浏览 3提问于2013-07-16得票数 0
我用java编写了一段代码，用于解析将要使用的xml文件。现在我有麻烦了。我的数据集是AIMed，如下所示： <text> We screened proteins for interaction with presenilin (PS) 1, and cloned the full-length cDNA of human delta-catenin,
浏览 1修改于2015-12-08得票数 0
他们实际上正在寻找工具来执行DNA序列分析、蛋白质验证、估计和许多与生物学相关的任务。是否有科学的，面向生物的Ubuntu版本？
有没有像上面提到的那样进行科学分析的工具。
浏览 0修改于2012-09-14得票数 13
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我正在写一个程序，执行基本的定量生物学操作。我有两个独立的文件，一个是.h，另一个是.cpp。.h包含带有函数原型的类，.cpp包含函数定义。我觉得我写的代码是正确的，但它不能编译。
浏览 0修改于2013-05-11得票数 1
我在一个生物学实验室工作，我必须设计一个数据库来存储许多DNA微阵列实验结果。
每个实验由多个微阵列组成(平均10个)，每个微阵列包含500多万个探针。
浏览 12修改于2012-04-05得票数 5
我是一个疯狂的生物学家，一夜之间试图了解密码学的世界进行研究--请不要理会我的无知。我得到了大量要破解的文本，这些文本用PKCS5填充的AES-128-CBC加密。
浏览 0修改于2017-05-24得票数 -5
请考虑以下问题(declare-fun x2 () Bool)(declare-fun x4 () Bool)(and (= (and x2 x3) x1) (= (and x1 (not x4)) x2) (= x2 x3) (= (not x3) x4)))(check-sat)(assert (= x4 false))(get-m
浏览 0修改于2017-05-23得票数 2
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我正在使用，并且在使用这个应用程序接口时步履蹒跚，因为我在任何地方都找不到非常清晰的文档或示例。它们是系统发育树，其中每个节点是一个物种，注释将标记特定节点上是否存在某些基因，并且可能有足够少的基因，以至于一个字符串就足够了(例如，如果有三个基因A、B和C，则可能的节点注释可能是"AB“、"AC”或"")，并且必须允许这不是唯一的(因为两个节点可能具有相同的基因集)。
目前，我正在以New
浏览 3提问于2016-08-26得票数 1
我有一个fastq文件的文件夹(基因组序列)和一个带有条形码的excel文件(一系列20个核苷酸)，我想搜索所有fastq文件中的所有条形码，并获得精确的匹配。我单独使用了"zgrep -u barcode file1 file2 file3“来测试几个条形码，它可以工作，但现在我想创建一个脚本来为我做这件事，因为我有大约200个不同的条形码要在10个文件中查找。我不确定如何才能将zgrep整合到这样的脚本中。
浏览 10修改于2021-06-18得票数 1
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我想要在黑白图像中反转颜色，然后用以下代码更改透明背景： imgg = Image.open('HSPl4_E5_LP8.png')
img = Image.open('new HS
浏览 20提问于2020-09-25得票数 0
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