什么是系统生物学标记语言？
什么是系统生物学标记语言？
提问于 2020-02-08 09:25:45
有人能总结一下SBML是什么吗？这个首字母缩写代表什么，它的目的是什么？我听说它跟系统生物学和计算生物学有关？它用于什么类型的计算生物学？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-02-10 05:46:22
SBML是系统生物学标记语言的缩写。它是一种基于XML的交换格式，用于系统生物学和计算生物学中的计算模型。其核心是通过反应和物种对基于过程的模型的描述。SBML是这种计算模型交换的事实上的标准，它被广泛用于编码动力学途径模型(例如代谢途径或信号网络)或基于约束的代谢模型(例如通量平衡分析)。SBML由核心语言和包组成，这些包通过附加功能扩展了它的功能。例如，有一个用于分层模型组成或通量平衡分析的软件包。有关详细信息，请参阅：
- http://sbml.org/
- the最新语言规范：Level 3 Version 2 (L3V2)
- The描述SBML的原始文件：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12611808
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/60123139
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