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For Loop -
生存
分析
我正在尝试对一种特定癌症类型中的数百个基因进行
生存
分析
。我有两个数据帧(m2和m3)。m2包括样本ID以及总体存活率(样本已经存活了多长时间)和状态(如果样本是活着还是死了)的列。我正在尝试确定哪些基因在比较它们在
生存
中的作用时具有统计学意义。我正在尝试运行一个for循环来运行这个survdiff函数并生成p值,但是总是得到一个错误。
浏览 0
修改于2018-02-11
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生存
分析
--总体
生存
中位数
我正在尝试运行一个脚本来计算KM中值总存活率和无进展存活率,但一直收到无效的'row.names‘长度错误消息。Patient # PFS OS Alive POD2 5 5 1 0我的脚本如下: survFitOS <- survfit(Surv(data_set$OS,data_set$Status) ~ 1,
浏览 49
修改于2018-07-25
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回答
生存
分析
中的
生存
时间
我在
分析
我的
生存
数据集时遇到了问题。我将把dataset的dput输出放在github链接中,以避免污染这个问题。这是数据变量W1,W2,..,W43表示周数,数字表示某种度量。在一个
生存
模型中,这个死亡代表了一个事件(失败),如果个体在所有的周内
生存
,他代表一个被审查的数据。为了像我知道的那样建立一个
生存
模型,我需要像下面这样的数据event=c(1,1,
浏览 2
修改于2016-09-30
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回答
R:自动
生存
分析
下面,我有一个转换表patientID -到
生存
时间,以天为单位。例如,对于基因1 ("BIX"),鉴于高表达和低表达的Kaplan
生存
曲线(即high[[1]]对low[[1]]),我希望从这两个载体的对数秩测试中提取相应的p值(回答以下问题:高表达和低表达患者的
生存
结果是否存在显著差异
浏览 1
修改于2015-03-03
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回答
创建
生存
分析
数据集
我试图用R中的
生存
软件包进行
生存
分析
。 risk.table.col = "strata", # Risk table color by groups然而,mydat本身并不能作为
生存
分析
的输入由于输出如下所示 提前谢谢。
浏览 4
修改于2016-09-02
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回答
TensorFlow中的
生存
分析
我一直在使用标准软件包在R中进行
生存
分析
,我知道如何在TensorFlow中进行分类问题,如logistic回归,但我很难将其映射到
生存
分析
问题。
浏览 4
提问于2017-04-07
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回答
生存
分析
: coxph的扩展
我目前正在尝试在
生存
数据上实现R中Cox模型的Prentice,Williams和Peterson扩展,但我想要一个参数模型,但无法完成。
浏览 0
提问于2014-08-29
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3
回答
精算
生存
分析
,分为区间
我正在尝试在R中创建一个精算
生存
分析
(我正在遵循一些实际的例子)。我认为最好的方法是使用survival包。
浏览 1
修改于2014-01-30
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0
回答
应用函数进行
生存
分析
56 30603 ... 23999100 Patient_100 1 853 ... 25888 coxph( Surv(time, event) ~ group, data=dataframe )[['coefficients']]然后我做cox比例风险
分析
浏览 5
修改于2016-12-29
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2
回答
机器学习还是
生存
分析
?
几天前,我读到了关于
生存
分析
的文章,现在我陷入了一个难题:问题是
生存
分析
还是机器学习?
浏览 0
提问于2016-07-20
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回答
贝叶斯
生存
分析
我想使用威布尔分布来构造用于
生存
分析
的stan(rstan)代码。但是我的stan代码总是不能工作。如果有人知道如何处理我的问题,请教我。
浏览 3
修改于2018-09-16
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1
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PyMC 3的
生存
分析
我试图将简单的
生存
模型从PyMC 2移植到PyMC 3,但是,我没有发现任何与“观察”装饰器等价的东西,我试图编写一个新的发行版也失败了。有人能给我们举个例子吗?在PyMC 3中是如何做到的?
浏览 5
提问于2014-02-25
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回答
随机森林
生存
分析
崩溃
我正在尝试对6500条记录的数据帧运行RFSRC,其中包含59个变量:当我在1500条记录上运行它时,它似乎可以工作,但在整个数据集上崩溃。你有什么想法怎么调试这个吗?我在数据库中浏览了一下奇怪的行,但一无所获。
浏览 0
修改于2019-03-06
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2
回答
do,
生存
分析
和dplyr
我试图计算按医院、疾病级别和年份划分的不同患者的中位
生存
期。在plyr中,这是相当简单的,但是我正在尝试使用dplyr (因为它的速度)来提高速度。如何将生成的m6数据turn转换为“有用”的数据以供后续
分析
?有关于dplyr中的do函数的教程吗?
浏览 2
修改于2015-11-04
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回答
使用R进行
生存
分析
在使用
生存
包运行
生存
模型时,我遇到了一个奇怪的错误消息,我无法理解。
浏览 0
修改于2014-11-20
得票数 0
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使用插入符号进行
生存
分析
(随机
生存
林)
是否有办法使用caret进行
生存
分析
。我真的很喜欢它的易用性。我试着用插入符号列表中的party包来拟合一个随机
生存
森林。我可以使用其他面向
生存
分析
的包吗? 谢谢
浏览 1
修改于2015-11-07
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1
回答
离散型
生存
分析
中的异常值检验
我正在试图弄清楚如何在离散
生存
分析
中对异常值进行适当的测试(我使用逻辑回归)。我为连续
生存
分析
找到了几个建议,但对离散
生存
分析
没有任何建议。 建议的方法,垃圾或类似的高度赞赏!
浏览 2
提问于2014-07-02
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回答
生存
分析
中的数据清理
我正在清理一些数据,以便进行
生存
分析
,并且我试图使它成为一个人只有一个,持续的,从症状出现(ss=1)到症状缓解(ss=0)的过渡。个人必须获得完全持续的缓解,才能算为缓解。
浏览 1
提问于2016-04-19
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回答
后进
生存
分析
的语法
我试图使用survival包来拟合一个使用左截尾数据的
生存
模型,但是我不确定正确的语法。 假设我们正在测量雇用时年龄(age)和工作类型(parttime)对公共卫生诊所医生就业时间的影响。玩具数据与Singer和Willet的应用纵向数据
分析
第15章中讨论的数据集具有完全相同的结构。我试着与他们报告的结果相匹配,但没有成功。关于如何对R中的左截数据进行
生存
分析
,网上并没有很多明确的信息,而提供书籍代码的网站()也没有为相关章节提供R代码。
浏览 1
修改于2018-05-21
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回答
如何传递数据进行
生存
分析
我试图用R建立我的
生存
分析
数据,我有四个变量T1,T2,T3,T4,每个变量都代表了评估参与者的时间点。代码1和2表示它们没有通过测试;代码0表示它们通过了测试。
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提问于2022-02-02
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