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首先，我将SSH放入的服务器缺少加载数据的内存，因此需要将计算节点资源请求为torque作业，如下所示：qsub: submit error (Job rejected by all possible destinations (check syntax, queue resources给出的作业数组请求是：
qsub -t 1-$1 -l vmem=16G -l nodes=1:ppn=1,walltime=48:00
浏览 1提问于2014-10-20得票数 1
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他们中的每一个人都在等待着在开始之前做一个预先的qsub。for ID_FILES in `ls Infiles_dir/*.txt`;JOB_ID=`echo "perl perl_scirpt.pl $ID_FILES" | qsub-j oe `
JOB_ID_ARRAY="${JOB_ID_ARRAY}:$JOB_ID"
浏览 1修改于2013-08-05得票数 2
我正在尝试在crontab中执行qsub脚本。在crontab txt文件中，我尝试：我得到的错误是"/bin/sh: qsub: command not found“。
浏览 3提问于2013-03-05得票数 3
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$2不是shell变量，但是当我试图将此代码提交给qsub时，$2被解释为$2。也就是说。结果是qsub执行命令。我在中尝试了一些建议，包括\$2和这两样都不管用。我当然可以将awk放在脚本中，并以这种方式调用qsub，即qsub awkscript.sh。但是，如果有一种从命令行使用qsub+awk的方法，
浏览 3修改于2021-03-03得票数 1
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然后我打开'PUTTY'，登录，然后必须输入'qsub s01.sh'，'qsub s02.sh‘....等。
如果有数百个工作，那么手动键入数百个工作是一项真正的劳动。有没有办法同时运行多个'qsub‘命令？
浏览 2修改于2016-10-15得票数 1
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#!/bin/bash#PBS -N garunsmodel#PBS -l walltime=1:00:00#PBS -e error/error.txt#PBS -A improveherds_myc=$PBS_ARRAYID
cp -r /group/dairy/phuongho/garuns $nodeDir
cp /grou
浏览 0修改于2016-08-13得票数 0
在SGE中，我们有通过"-now yes“可以立即调度作业(如果可能)或者根本不调度作业。我们没有被放入挂起队列中。但在LSF中，我们有等同于bsub的qsub。附言:一种解决方案是，我们可以在运行bsub后检查一段时间(一些秒)，看看我们是否按计划运行，然
浏览 12修改于2013-08-08得票数 0
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我将使用qsub命令分发我的工作，我想要的是我可以得到作业id，以便我可以监视作业。#!/bin/bash# Monitoring base on $JOBID
我找到了一个页面，它谈到了一个变量PBS_JOBID，但我不知道如何使用它。(我现在的解决方案是jobID='qsub task | cut -d ' ' -f 3')
浏览 3修改于2015-03-14得票数 9
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是否可以在对qsub的调用中指定多个主机组？ 规范规定，您可以使用以下语法指定主机组： -q long.q@@long.hgc (如果long.hgc是主机组) 但我想知道是否可以指定多个主机组。
浏览 17提问于2019-09-15得票数 0
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我必须使用qsub (SGE)编写一个python脚本来提交作业。我要执行的命令如下所示：
log.info('executing: '+' '.join(map(str,
浏览 0提问于2019-03-19得票数 2
如何将网格上执行的shell脚本参数化(从qsub开始)？我有一个shell脚本，其中我使用getopts读取参数。当我开始(qsub script.sh -r firstparam -s secondparam .)这个具有qsub I的工作脚本接收错误消息，
qsub:非法-r值正如qsub所认为的那样，参数是针对自身的。
浏览 2修改于2012-01-16得票数 49
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是否有适当嵌套qsub调用或连续调用qsub调用的方法？目前，我的尝试是让第一个脚本在第二个脚本结束之前调用它，但是当我尝试从第二个(嵌套)qsub得到一个奇怪的错误消息时：qsub -v outpath='/home/dest_folder/' compile.pbs
该outpath变量只指定在何处复制新的可执行文件
浏览 5修改于2016-05-23得票数 0
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我正在尝试从qsub调用运行一些samtools命令(在集群上运行)。由于某些原因，这些命令似乎无法识别。但是，如果我复制粘贴命令并直接从终端集群运行它，它就能正常工作。谢谢,我的qsub (这不起作用)：#.
浏览 6提问于2015-02-16得票数 0
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目前，我正在使用qsub在集群上运行作业，并对这些作业设置了10小时的墙时间。有时工作超过这一时间，因此被终止，有时由于其他原因而终止工作。无论哪种方式，我都希望在qsub日志文件的底部有一个脚注，它将指示作业何时终止(可选地使用状态代码指示它是成功完成还是被中断)和总壁时间。放置类似于：command here在qsub文件中，由于最后一个date将不会被执行，如果作业持续了一段时间，它就无法工作。有谁知道怎么绕过这件事吗？
浏览 0提问于2014-08-12得票数 1
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我一直在寻找一种简单的方法来捕获由qsub提交的作业ID。我看到有人建议给这份工作起一个名字，并使用这个名字。但这是个间接的方法。我试过这样做，但出错了35546.cell0 (This is the output I want to capture)
有谁能建议一种简洁的方法从qsub获取工作ID吗？
浏览 4修改于2013-12-25得票数 3
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我需要用qsub来完成这个任务，所以我创建了一个简短的bash脚本，它编译我的Java文件，然后运行主脚本。我(仍在使用qsub)如何恢复这种交互性？在没有qsub的情况下，我的代码会打印大量的结果，所以我也想这样做。
谢谢你的帮助！
浏览 0提问于2015-11-06得票数 1
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