如何从qsub获取作业id

Question

我正在使用一个集群。我将使用qsub命令分发我的工作，我想要的是我可以得到作业id，以便我可以监视作业。

基本上，我想要这样的东西：

#!/bin/bash
JOBID=$( qsub job1 )
# Monitoring base on $JOBID

我找到了一个页面qsub，它谈到了一个变量PBS_JOBID，但我不知道如何使用它。有人知道怎么做吗？

(我现在的解决方案是jobID='qsub task | cut -d ' ' -f 3')

Answer 1

qsub有一个非常可预测的输出。许多自动提交系统(如网格接口)只需解析来自qsub的输出，就可以查找作业as。

解析的一个例子来自BLAHP项目(欧洲网格中间件)。

jobID=`${pbs_binpath}/qsub $bls_tmp_file` # actual submission
...

# The job id is actually the first numbers in the string (slurm support)
jobID=`echo $jobID | awk 'match($0,/[0-9]+/){print substr($0, RSTART, RLENGTH)}'`

(来源)

此代码在生产中已经使用了多年，并且在PBS、PBS Pro和SLURM中都为qsub工作过。

Answer 2

您可以使用-terse

$ echo sleep 5 | qsub -terse
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