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我使用glmmTMB运行了一组23种模型。(我已经将我的模型设置为一个list，下面的示例代码)cand.models[[1]]<-glmmTMB(count~depth + slope + SST +(1|individual), family=list(family="truncated_nbinom1", link="log"), data=df)
cand.models[[2]]<-glmmTMB有人知道为什么它没有提供这种偏差(也许
浏览 1修改于2017-10-22得票数 3
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我的模型是这样的：+ offset(log_total_counts)但是，我需要将此分析移植到本地集群，因为我需要多次运行这些glmmTMB测试。因此，我使用以下命令在集群上安装了glmmTMB当我运行时没有任何抱怨：
library(glmmTMBv
浏览 5修改于2018-07-08得票数 1
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我试图模拟光合响应(fvfm)，它的值从0到0.7，我使用的是β分布，因为我的通货膨胀为零，我考虑了一个色散模型，因为我的值随着时间的推移而偏离平均值，但是在运行这个模型时：
beta7<-glmmTMB
浏览 5修改于2020-02-05得票数 0
我的目标是在应用于dredge()模型时尽可能加快glmmTMB()函数的速度。我知道这两个函数都可以并行化：glmmTMB()与control参数，dredge()与cluster参数。::glmmTMB(y ~ x1 + x2 + x3, data = df), # Parallel model with "cl" Unit: secondsglmmTMB::<e
浏览 13提问于2022-10-27得票数 1
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我正在使用一个伽马分布的多变量模型，我想利用glmmTMB中部署的lme4语法，然而，我注意到我的模型有一些奇怪的地方。显然，当我使用stats::glm时，该模型很容易收敛，但在glmmTMB框架中似乎给出了一个错误。calories ~ fat*fiber, family = Gamma(link = "log"), data = d) # Dos parámetros con interacción
m4.2 <- glmmTMB
浏览 63提问于2019-05-17得票数 0
我正在尝试创建一个栅格，并使用glmmTMB对模型进行预测。这是基于一个模型，和一个光栅堆栈。我将光栅堆栈转换为数据帧，因为我认为这是函数predict.glmmTMB运行的必要条件。模型 scalepredstack <- as.data.frame(stack2) glmmTMB:::predict.gl
浏览 4修改于2022-06-23得票数 0
我正在运行一个零膨胀的glmmTMB模型。我感兴趣的是，对不同的因素水平进行两两比较，无论是条件因素还是零通胀因素。条件部分，我可以很容易地使用通常的emmeans方法。我一直在尝试使用(相对的)新创建的glmmTMB:::emm_basis.glmmTMB，但是找不到函数所使用的一些参数，也找不到例子.mod <-
浏览 1提问于2020-06-12得票数 0
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我们正在使用glmmTMB包执行beta混合效应回归分析，如下所示： formulapar1 + par2 + par3 + family = glmmTMB对于具有正态分布因变量的lms，我们将使用anova，但这里我们不确定它是否适用于具有beta分布或glm
浏览 15提问于2022-09-02得票数 0
作为一个可重复的例子，让我们使用下一个无意义的例子：> summary(glmmTMB(am ~ disp + hp + (1|carb), data = mtcars所以，我试着：Error inglht.matrix(glmmTMB(am ~ disp + hp + (1 | carb),
浏览 0提问于2020-06-07得票数 2
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我试图使用包glmmTMB为DHARMa模型生成诊断图，但没有成功。本中的示例1.1给出：
MacOS塞拉利昂版10.12.6。编辑：，我的问题最初是关于包performance和DHARMa如何处理glmmTMB对象。为了集中精力和清晰起见，我删除了
浏览 2修改于2021-04-28得票数 1
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许多人在网上寻找一种方法，对glmmTMB中的条件模型(固定因素)进行事后分析。我想在某些群体之间做一个有计划的对比，而不是测试每一个成对的比较(例如，Tukey)。modelparm.default(model, ...) : 有没有办法在glmmTMB= "TOT" & BURN == "N" & VEG == "C")
filtdens$TD
浏览 0修改于2018-08-17得票数 3
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我使用glmmTMB库在R标记文档中运行混合模型。= integer(0), :我的代码如下所示：我尝试用glmmTMB重新安装TMB和dependencies=TRU
浏览 8提问于2021-04-11得票数 5
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我正在尝试为glmmTMB (家族: nbinom1)中的模型估计计算95%的置信区间。model = glmer.nb (response ~ p1 + p2 + (1|block))我认为glmmTMB有没有人能帮我用glmer下的glmmTMB模型来实现这个功能呢
浏览 19提问于2019-08-02得票数 1
我正在尝试使用包glmmTMB。当我调用库(GlmmTMB)时，这是错误消息：
“>库(GlmmTMB)错误:inDL中的‘glmmTMB’(x、as.logical(本地)、as.logical(现在)、.)中的包或命名空间加载失败:函数'Rcpp_precious_remove‘不是由包'Rcpp’提供的，此外:警告消息: 1: package‘glmmTMB’是在RVersion4.0.5 2: In checkMatrixPackageVersion
浏览 11修改于2021-12-06得票数 0
我使用glmmTMB分析负二项式广义线性混合模型(GLMM)，其中因变量是计数数据(CT)，它是过分散的。library(glmmTMB)
offset(LOG_TOT), data = df, verbose我听从本的建议，跑
source(system.file("other_methods","lsmeans_methods.R",p
浏览 1修改于2018-07-15得票数 2
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我想用R中的glmmTMB函数拟合一个随机效应模型，我指定模型为模型= glmmTMB(Y ~ (1+x1+x2|group))。有人知道如何用glmmTMB来拟合随机效应模型吗？谢谢!我以为glmmTMB能帮我做到这一点。
浏览 8提问于2022-10-26得票数 0
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我正在将为glmer/merMod模型编写的一些k折叠交叉验证代码改编为glmmTMB模型框架。我可以让这一行使用glmer模型工作，但是当我使用glmmTMB运行相同的模型时，我得到了Error in model.matrix: requires numeric/complex matrix/vectorlibrary(lme4)data(mtcars)
# Model both with glmmTM
浏览 7提问于2022-01-19得票数 1
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data(sleepstudy,package="lme4")model.sel(g0)上面的代码运行得很好，但是，这却不是：datT<-read.csv('datT.csv')
myModel<-glmmTMB(y~x1+x2+ (1|randomEffect),list(
浏览 4修改于2018-06-14得票数 1
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