glmmTMB 'giveCsparse‘每种型号的警告

Question

我使用glmmTMB库在R标记文档中运行混合模型。我运行的任何模型都会收到以下警告：

'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

然后，如果我在控制台中运行代码，就会得到以下警告：

Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

我的代码如下所示：

m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group), data = bd, family = "poisson")

我尝试用glmmTMB重新安装TMB和dependencies=TRUE，但是消息不断出现。显然，它根本不影响模型，但无论我做什么测试或图表，我总是收到警告。能解决这个问题吗？还是我就这么无视它？

Answer 1

是无害的。您可以：

1. 从CRAN安装最新版本的glmmTMB (目前为1.1.2)。
2. 忽视它
3. 使用suppressWarnings() (可能会丢失其他相关警告！)
4. 从GitHub安装开发版本，它是用此承诺修复的。(存储库中的二进制包现在也已经更新。)

或者您可以将您的Matrix版本降级为旧版本(使用remotes::install_version()或snapshot包)