glmmTMB分段故障

Question

我的模型是这样的：

m1 <- glmmTMB(counts ~ fixed1*fixed2 + (1|random/nested_random) 
+ offset(log_total_counts), data = long_data_frame,
verbose=FALSE,family="nbinom2")

下面是115行long_data_frame中的前6行：

fixed1   fixed2   random    nested_random   counts    log_tot_reads_orig
0        0        1         1               643       12.89582
1        8        2         6               585       13.67509
2        25       3         11              846       13.94209
3        75       4         16              755       13.93056
4        0        5         21              1428      13.65672
6        8        6        26               1566      13.64421

该模型在我的Mac笔记本电脑(OS 10.13.4)上运行到完成。但是，我需要将此分析移植到本地集群，因为我需要多次运行这些glmmTMB测试。因此，我使用以下命令在集群上安装了glmmTMB

install.packages('package_name', dependencies=TRUE)

当我运行时没有任何抱怨：

library(glmmTMB)

但是，当我在集群上运行模型的一个单独示例时，我得到了以下错误：

 *** caught segfault ***
address (nil), cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: retape(set.defaults = TRUE)
 2: MakeADFun(data.tmb, parameters, map = mapArg, random = randomArg,     profile = NULL, silent = !verbose, DLL = "glmmTMB")
 3: eval(substitute(expr), data, enclos = parent.frame())
 4: eval(substitute(expr), data, enclos = parent.frame())
 5: with.default(TMBStruc, MakeADFun(data.tmb, parameters, map = mapArg,     random = randomArg, profile = NULL, silent = !verbose, DLL = "glmmTMB"))
 6: with(TMBStruc, MakeADFun(data.tmb, parameters, map = mapArg,     random = randomArg, profile = NULL, silent = !verbose, DLL = "glmmTMB"))
 7: fitTMB(TMBStruc)
 8: glmmTMB(copy ~ week * conc + (1 | pool/cell) + offset(log_tot_reads_orig),     data = subset(copy_raw_sub_l, copy_raw_sub_l$id == i), verbose = FALSE,     family = "nbinom2")

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace

以下是关于集群的一些信息：

Sys.info()
                             sysname                              release 
                             "Linux"         "2.6.32-696.18.7.el6.x86_64" 
                             version                             nodename 
"#1 SMP Thu Jan 4 17:31:22 UTC 2018"                             "login2" 
                             machine                                login 
                            "x86_64"                            "bob" 
                                user                       effective_user 
                           "bob"                            "bob" 

以下是有关glmmTMB的信息：

installed.packages('glmmTMB')
     Package LibPath Version Priority Depends Imports LinkingTo Suggests
     Enhances License License_is_FOSS License_restricts_use OS_type Archs
     MD5sum NeedsCompilation Built

"MD5sum需要编译构建“看起来是错误的？我想，几乎可以肯定的是，这是集群环境的问题？我将非常感谢关于如何解决这个问题的建议，或者关于集群中哪些可以修改或升级的建议，然后我可以向我的本地管理员提出建议。非常感谢！