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在
circos
中使用
circos
函数
如何在数据中添加
circos
函数?当我尝试的时候,我得到了一个错误信息,它没有产生任何结果,我想做一个像数字1这样的圆环图,但我有一个其他的结果,我们可以在另一张图中看到。(filename="plot_2.png", plot=p2, height=7, width=7)
circos
.par
浏览 37
修改于2021-05-01
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2
回答
你好,
circos
的世界例子?
有人能为我提供一个
circos
的"hello world“示例吗?(www.
circos
.ca)那么,有谁能帮我一下吗?
浏览 10
修改于2014-05-12
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1
回答
离散轴
circos
图的软件推荐
我想做一个类似
circos
的情节,只可视化SNP( SNPs属性有多个音轨)。它可以用python、R或者我很乐意考虑其他语言来完成。3 C 2100394 21 50library(circlize)
浏览 14
提问于2019-09-17
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1
回答
创建圆形流程图(
circos
)
我一直在用伤寒试着用
circos
。盖菲仍然在测试版上,
circos
需要大量的配置才能得到图表。我正在寻找更容易的东西,可以将csv文件转换成这样的图表。
浏览 3
修改于2015-11-12
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1
回答
R包圆圈:
circos
热图颜色未出现
", split <- factor(annot$Case_type) 'no evidence of disease' = '#acff59')
circos
.par(start.deg
浏览 8
修改于2022-03-16
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1
回答
如何在
Circos
中去除直方图网格
我正在使用
Circos
绘制一些直方图。我怎样才能摆脱下面例子中的垂直网格呢?
浏览 5
修改于2012-11-15
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1
回答
Circos
错误:缺少必需的模块
Use CPAN to install it as described in this tutorial http://www.
circos
.ca/documentation/tutorials/configuration
浏览 3
修改于2014-02-13
得票数 0
3
回答
用matplotlib绘制‘'
circos
’风格的图?
有没有人知道有没有办法用matplotlib的python包或者其他的python库来绘制图?它们不需要看起来像示例那样漂亮。
浏览 6
修改于2012-02-29
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2
回答
修改
circos
图像的最简洁方法
我想要一些建议:我已经用
circos
(dna数据)创建了一个图像。我想通过在图的中间绘制一个基因名称来注释这个数据,并用一个箭头来显示第一个基因的起点。除了
circos
之外,我还在使用matplotlib和reportlab,所以我希望其中之一是可行的。编辑:我想画两样东西。
浏览 6
修改于2015-07-25
得票数 1
1
回答
安装
Circos
:在Mac上安装GD模块的问题
我想安装
Circos
。我在
Circos
网站上跟踪了。特别是,我检查了缺少的perl模块。Polylinemissing Statistics::Basic所以我在
Circos
libpng brew link --overwrite --dry-run libpng 有什么办法能最终运行
Circos
浏览 0
修改于2017-05-23
得票数 0
1
回答
R圈:
circos
.initialize中的误差
mfrow = c(3, 2))chordDiagram(mat)Error in
circos
.initialize
浏览 2
修改于2016-04-11
得票数 13
1
回答
circlize::
circos
.heatmap增加细胞间的间隙
'Plasma' = '#fcff5c', 'Both' = '#14f9ff')
circos
.heatmap(annot,track.height = 0.4,
浏览 4
提问于2022-03-16
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1
回答
如何解决
Circos
SVG文本放置不正确的问题?
这里有一个特写,来澄清这个问题:如果我从
Circos
而不是SVG输出PNG,则会正确绘制标签,但随后将无法在Adobe Illustrator或Inkscape中标记矢量格式的SVG图形。下面是与添加标签相关的
circos
.conf文件的一个片段:dir = /tmppng = yesbackground
浏览 4
提问于2011-12-13
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1
回答
R中非结构化数据的
Circos
图
我有100多个观察点(spot),我在那里观察特定的项目(例如,A,B,C..etc)。数据的基本格式如下:spot2<-c("C","NA","D","D","D")spot4<-c("H",&
浏览 19
修改于2019-10-27
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1
回答
circos
.heatmap():rowMeans(m)中出错:'x‘必须是至少二维的数组
library(ComplexHeatmap)col_fun1 = colorRamp2(c(-2, 0, 2), c("blue", "white", "red"))
circos
.heatmap(mat = mat1, split = split, col = col_
浏览 107
提问于2021-07-28
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1
回答
将百分比标签添加到圆形的
circos
.barplot中的条块内
()
circos
.par(cell.padding=c(0,0,0,0)) panel.fun=T,cex=.75,col=labelcolor[cut[labels[i]]]))
ci
浏览 50
提问于2021-05-12
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回答
在Mac OS Big Sur版本11.0.1上安装
circos
时缺少GD
我发现在MacOS上安装
circos
非常非常困难,我在谷歌上找到的所有答案都相当生疏,在MacOS Big Sur版本11.0.1上对我不起作用。以下是我所遗漏的: (base) user@user-MacBook-Pro %
circos
-modulesok 0.45 Clone ok
浏览 107
提问于2020-12-14
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1
回答
R:
circos
图中的组交叉点,显示具有可变值的额外带。
2-包含一个额外的信息带到
Circos
图中,其中FoldChange值(红色表示负条,蓝色表示正条)。最好是重叠的Genes块都在一起(而不是到处都是细毛,而是根据FoldChange值排序)。与此类似的可能是: 然而,我真的不知道如何开始,我曾经尝试过用circlize包制作简单的
Circos
图,但是完全失败了。我认为我想要实现的目标的概念很简单.有没有人知道如何在
Circos
的情节中清楚地表现出来(或者说,你可以建议的其他任何表现形式)? 非常感谢!
浏览 1
修改于2017-11-28
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1
回答
用圆圈绘制chordDiagram时的错误:“
circos
.initialize中的错误”
我得到的错误是:chordDiagram(Data2) 代码的第二部分使用Data2生成:“
circos
.initialize中的错误(factor=factor( xlim,level = cate
浏览 2
修改于2017-05-23
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3
回答
R:圆圈
circos
图-如何在重叠最小的扇区之间绘制不相连的区域
我想要制作一个
circos
图,它反映了不同患者群之间的共享功能与细胞类型之间的很少联系,同时给出了每个组中有多少未共享的功能。看下面的例子,我的实际数据是如何更准确的,并看看如果使用这个例子,我们可以得到最后的
circos
图!谢谢!!#NON OVERLAPPING SETS!subsets of sharedall, but not between sharedall, sharedparts, sharedcells, and nonshared #I NEED A
CIRCOS
浏览 3
修改于2017-03-28
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