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我需要biomaRT，但它没有安装。我该怎么解决这个问题？生物导体版本3.14 (BiocManager 1.30.16)，R4.1.3 (2022-03-10)警告消息:当版本与当前版本相同时未安装软件包；使用force = TRUE重新安装：“biomaRt
浏览 15提问于2022-04-07得票数 0
我试着按照这个网站的答案来做，但是这个命令不再起作用了：在等待了很长时间后，我得到了以下错误： Request to BioMartAlternatively the BioMart web service is temporarily
浏览 5提问于2017-10-13得票数 2
在查找biomaRt hgu133a探测集ids的entrez ids时，我遇到了一个关于affymetrix包的问题。例如，biomaRt找不到"206323_x_at“。library(biomaRt) affyids="206323_x_at"
浏览 1提问于2012-07-12得票数 3
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问题当我运行以下安装命令时：install.packages("BiocManager")Bioconductor version 3.10 (BiocManag
浏览 5提问于2020-09-16得票数 0
我正在尝试安装Biomart软件包，我使用了以下代码： biocLite("biomaRt")library("biomaRt")Warning messages:6: In inst
浏览 3提问于2019-02-28得票数 1
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我正在使用Biomart Perl API从web服务器下载数据。有时我会收到错误信息: Problems with the web server: 500 read timeout。
浏览 5修改于2014-07-25得票数 0
我有一些基因组位置，我想注释这些位置(查找Ensembl基因ID，外显子，内含子，.)基于Ensembl使用biomaRt R软件包。
浏览 7修改于2016-11-06得票数 2
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我使用以下代码从Entrez ID中检索基因符号：ensembl <- useMart("ENSEMBL_MART_ENSEMBL", dataset = "hsapiens_gene_ensemblAlternatively the BioMart web service is temporarily down.stop("Request to BioMart web service failed. Verify if you are
浏览 13提问于2016-07-08得票数 2
ibrary(biomaRt)
ensembl <- useEnsembl(biomart = "ensembl",
浏览 1提问于2021-05-30得票数 1
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我正在使用R中的biomaRt查询ensembl的人类基因hsapiens数据库。我正在使用函数getBM获取所有基因的名称、起始位置和停止位置，但我找不到正确的属性来检索转录起始点( TSS )。
浏览 1修改于2012-10-23得票数 3
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我正在尝试使用biomaRt。我尝试的代码是；datasets <- listDatasets(ensembl)
values = values,
mart = useMart(biomart
浏览 2修改于2015-04-22得票数 0
我需要在R中使用biomaRT来获得一个完整列表的相应基因ID，该列表包含不同的Refseq和多肽。除此之外，我还需要保留肽序列和最终结果，我该怎么做呢？
浏览 2修改于2022-04-09得票数 1
我用R编写了一个程序，通过biomaRt库找出数据库中的所有候选基因。我正在尝试使用rpy2将R脚本转换为python文件。mart <- useMart(biomart="ensembl", dataset="hsapiens_gene_ensembl")
R.library("biomaRt</em
浏览 3修改于2014-03-09得票数 0
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Biomart下载转录因子结合位点信息列表出错,总是下载了一部分后就中断,继续下载后,最后下载下来的是一个HTML文档
浏览 200提问于2020-04-26
我在安装带有bioconductor的biomaRt时遇到问题。/BiocFileCache’* removing ‘/home/legrand-lab/anaconda3/envs/r4-base/lib/R/library/biomaRt’
The d
浏览 148提问于2021-04-27得票数 6
这是我遇到问题的代码：library(biomaRt)ensembl_hsapiens <- useMart("ensembl",
浏览 7提问于2018-04-26得票数 0
现在我有这样的想法：>ensembl <- useMart("ensembl", dataset = "hsapiens_gene_ensembl")
>mapping
浏览 1提问于2018-11-16得票数 1
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我使用lapply和biomart来提取3个不同物种的同源物。我还需要提取所有同源的目标I，我还希望将lapply用于目标I，以使我的代码更有效率。到目前为止，我拥有的代码如下：library(biomaRt)species <- c("hsapiens", "mmusculus", "ggallus")
为所有物种建立到
浏览 6提问于2018-04-29得票数 0
我对R不是很在行，但我正在尝试学习如何使用biomaRt包来查找位于我感兴趣区域的基因。我已经设法使用ensembl数据集生成了一个有效的输出，代码如下：感谢您的支持。
浏览 17修改于2017-07-18得票数 0
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