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回答
如何查找所有唯一的文件名(消除重复项和路径)
例如,给定这些目录/文件夹和文件:dir-aa/subdir-cc/file-2dir-bb/
file-3
file-1
file-3
浏览 25
修改于2019-05-23
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1
回答
Bash中进程替换的执行顺序
's/ /3/g' >> file-2) \ echo 'a_ ' | tee \ >(sed 's/ /2/g' >
file-3
) \ >(sed 's
浏览 0
修改于2022-10-15
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1
回答
GitLab应用编程接口-检索存储库文件
Project-X - FileFoder-A - File-2 - Repository-2 - File-1 -
File
浏览 16
修改于2019-07-22
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1
回答
批处理:用相同的文件名替换所有文件
我有一个像这样的文件夹: folder-a-1 folder-a-2 file-4 file-1folder-b file-2 file-4 我正在寻找一个批处理(.bat),它根据文件名替换文件夹中的所有文件
浏览 1
修改于2018-03-26
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1
回答
从目录复制所有文件,而不是从子目录复制特定文件
我有一个目录结构如下: |----- file-1 |-----
file
destination-dir--- |----- file-2 |-----
file
浏览 0
修改于2021-05-20
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2
回答
文本处理:提取文件的部分并将其写入一行。
span>File-2:Field5 : </b> <span>DATA_FIELD_5 </span>
File-3
:Field2 : </b> <span>DATA_FIELD_2</span>
浏览 0
修改于2017-03-29
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4
回答
从向量中移除字符串/单词
[1] "Blast1.
bam
" "Blast10.
bam
" "Blast11.
bam
" "Blast12.
bam
" "Blast13.
bam
" "Blast14.
bam
" "Blast15.
bam
" [8] "Blast16.
bam
" "Blast17.
bam
&
浏览 4
提问于2021-07-19
得票数 1
1
回答
将一个文件夹合并到另一个文件夹,但保留diff (不存在)文件。
Folder-A-1 File-6 File-7 File-1
File
Folder-A-1我希望将Folder-A复制到/在Folder-B之上,这样,从逻辑上讲,结果是: File-1 *
File
浏览 0
提问于2018-04-28
得票数 1
3
回答
不重复的排列列
我有几个文件,每个文件都有不同的列数,例如:1 21 2 31 2 3 4 in
file
浏览 0
修改于2012-01-24
得票数 4
3
回答
在R中移除给定模式之前的字符
我需要删除(包括) "
BAM
/“之前的字符,并且只保留"
BAM
/"之后的字符并获得result。我想在循环中使用它作为输出的列名,这样一个班轮就更合适了。my.files<-c("/media/
BAM
/14066.
bam
","/data/
BAM
/14091.
bam
","/code/
BAM
浏览 1
提问于2015-08-14
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1
回答
Nextflow在进程之间操作变量
> ls out.barcoded.subreads.
bam
out.subreads.060--060.
bam
.pbi out.subreads.090--090.subreadset.xml out.subreads.149--149.
bam
out.subreads.192--192.
bam
.pbi out.subreads.249--249.subreadset.xml out.subreads.285--285.
ba
浏览 34
修改于2021-01-06
得票数 3
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1
回答
Makefile只执行第一个目标。
我有像这样的文件1_6_fa.
bam
1_7_fa.
bam
1_8_fa.
bam
1_9_fa.
bam
1_0_mo.
bam
1_1_mo.
bam
1_2_mo.
bam
1_3_mo.
bam
1
浏览 4
提问于2015-04-15
得票数 2
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1
回答
为来自两个不同文件的字典分配值
我有一个这样的
bam
.txt文件:exomesinglesample_out/
bam
/pfg002G.GRCh38DH.target.
bam
(l) [{'
bam
': None, '
bam
_index': None}, {'
bam
': None,
浏览 3
提问于2021-02-26
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2
回答
在数组散列中向文件名列表中添加前缀
_data.
bam
", "HG00117.
bam
_herc2_data.
bam
", "HG00119.mapped.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20101123.
bam
_herc2_phase1.
bam
浏览 2
修改于2015-03-16
得票数 1
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1
回答
按群集拆分
bam
,然后使用检查点按群集合并
bam
我有三个来自3个不同样本的单细胞
bam
文件,我需要通过集群将它们分成更小的
bam
。然后,我需要为相同的集群合并来自不同样本的
bam
文件。我试着使用检查点,但有点迷路了。the split_
bam
.sh will split the
bam
file to "01split_
bam
/{sample}/{sample}_{cluster_id}.
bam
" def merge_
bam
_input的输入将发生变化:
浏览 16
修改于2019-07-03
得票数 2
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4
回答
当在Awk中使用时,参数展开在其中一个列项上无效
我有以下文件,它将作为变量读入脚本中:/path/sample_B.
bam
B 1/path/sample_C2.
bam
C 2 /path/sample_A_string.
bam
A 1
浏览 0
修改于2019-01-29
得票数 1
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1
回答
linux在picard中合并多个文件
basic command: I=input_1.
bam
\ O=merged_files.
bam
.
bam
\ ... \ I=input_10.
bam
\java-jar picard.jar MergeSamFiles
浏览 64
修改于2017-12-22
得票数 0
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1
回答
snakemake中的命令行
我希望使用以下命令行在文件夹中创建一个
BAM
文件列表:但是,我想把它整合到snakemake中。怎么做?这是我试过的,但没有用: input: output: shell:
浏览 6
提问于2020-10-20
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2
回答
我的循环输出到一个连接的文件,而不是几个单独的文件
每个文件的格式都是: SampleName.
bam
.S.txt。 Example: 7805.
bam
.S.txt 7806.
bam
.S.txt 7808.
bam
.S.txt etc...cut -f 1,7 {} > {}.F \; and 2) for f in '*.S.txt';do cut -f 1,7 "$f" > "$f".F;done 我想要的是我的目录现在是 7805.
bam
.S.txt7805.
bam</em
浏览 19
提问于2021-02-02
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5
回答
Eclipse切换注释缩进
我有以下代码: if(foo) { if(bar) {public int doBam(int
bam
) {
bam
+= 1;//
bam
+= 1
浏览 0
提问于2010-11-19
得票数 28
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