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我试图保存用以下代码切片的3D数组的2D切片：import numpy as np
from nibabel.testing import data_path我需要2D数组才能将我的图像插入到一个自动的肺血管分割模型中，但我只有3D图像，有没有办法从上述3D图像中获取所有的切片而不是手工切片(就像我试图做的那样？)
浏览 4提问于2022-01-13得票数 1
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尝试使用numpy.rot90或skimage.transform.rotate旋转我的肺CT三维扫描图像，这些图像只包含感兴趣的肺区域，意味着它包含一些背景为黑色的白点，旋转如下所示：#numpy rotation
# reg_
浏览 0修改于2018-11-14得票数 0
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我遇到了一个问题，我正在努力制作肺的纯二进制掩模，其中像素值在肺内是1，在肺外是1。我使用了kmeans和otsu以及其他一些方法来分割肺部。我会附上一些例子图片。这是一个3d numpy数组的链接。它是所有切片中的一个，所以您可能只想尝试一个切片。
def HUValueSegmentation(图片，fi
浏览 2修改于2021-02-27得票数 0
1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.124239320067253523699285035604/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.952127023780097934747932279670
间距被读取为30而不是2.9，并且3D图像在两个肺切片之间有脑切片
浏览 0修改于2016-12-09得票数 0
(候选面罩是CT图像中特定肺结节/假阳性候选物的3d掩模。)
我周围的每个人都在说，胡的时刻只是为2D图像定义的。对文学作品的快速搜索似乎支持了他们。那么，谁能猜到作者们可能在这里做什么呢？(或者胡的时刻实际上可以扩展到3D?)
浏览 0提问于2016-03-16得票数 3
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在我的戴尔核心i7 -16 4gb内存-4GB 960兆GPU笔记本电脑上，我正在进行一个使用3d CNN对肺CT图像进行分类的项目。我在使用CPU版本的tensorflow。我的CNN模型有两个conv层，两个最大池层，一个FC层和输出层。使用这种架构，我可以使用大约(5000到6000)个样本来训练模型。在增加了更多的层后，我的模型现在有6层，3层最大池层，FC层和输出层.我的问题是，在用1000多个样本更改了体系结构之后，我的内存就被填满了，我得到了内存错误。我有两个问题：
为什么通过增加更多的层，
浏览 0修改于2018-10-01得票数 7
我想提取肺血管和支气管树，我更喜欢更好地代表这些器官几何形状的数据结构，而不仅仅是3D点的列表。
浏览 0修改于2017-02-09得票数 0
我正在制作一个人体模型，它有特定的器官需要突出显示，并在悬停时到达顶部并可点击。困难的部分，例如:肺与心脏重叠，我如何才能使心脏可点击而不把它放在肺的上面？
浏览 1提问于2014-12-26得票数 0
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其主要思想是使用非常深的神经网络，例如使用Inception模型。我正在考虑使用Inception模型，但似乎这不是一件容易的事情。,much_data[2][0].shape)Image 1 (133, 512, 512)例如，图像0 (128,512,512)但是我发现了一个为MNIST数据集生成Inception模型</e
浏览 4修改于2017-12-26得票数 0
我正在做一个3D容积 of CT肺部图像，为了检测结节，我需要为每一个疑似结节拟合一个椭球体模型，我如何为它做一个代码？这里一片容积CT肺图像在这里，另一个体积相同的切片，但它包含一个结节(黄色圆圈，有一个结节)，所以我需要我的代码来检查每个形状，以确定它是否是一个结节。
浏览 0修改于2018-03-23得票数 4
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我用tensorflow编写了一个用于python的CNN模型，该模型用于对肺CT图像(癌症/非癌症)进行分类，经过训练和验证数据训练模型并获得合理的准确性，毕竟，我需要用测试数据来测试模型，但我不知道如何做到这一点如何保存模型并将其用于测试？
浏览 0提问于2018-08-14得票数 0
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我有一个.txt文件，其中包含以下结构：2 PNEUMONIA/person1209_bacteria_3161.jpeg2 PNEUMONIA/person549_bacteria_2303.jpeg
2 PNEUMONIA/person831_bacteria_27
浏览 1修改于2020-05-24得票数 0
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我在x射线上运行了一个unet模型，用于肺区域分割，这个模型看起来很好，但是我的数据集不太好看，我正在获得一些缺少部分的结果，如下所示：我的问题是:是否有任何cv操作符，我可以预先准备，使它更平滑一点
浏览 0提问于2021-05-14得票数 1
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0.0141 1.1685 0在Matlab2013中，可以轻松地使用imwarp：I = nii.img; Rfixed=imref3d(size(I),dii(2),dii(1),dii(3));new_img= imwarp(old_img, Rfixed, tform, 'OutputView', Rfixed
浏览 1修改于2017-05-23得票数 3
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我只想分割出恶性(癌性)肺结节。起初，我设法把肺和所有可能的结节都切掉了。segM = % Segmented Lung BW = im2bw(segM, 0.55);
更新：
以大于3mm的结节为恶性(癌变)。如何从图像中计算以毫米为单位的尺寸？
浏览 1修改于2014-04-19得票数 1
Human Rat RNAtype Exp OrganASAP2 Asap2 reg5 HeartASAP2 Asap2 reg 6 Heart
ASAP2 Asap2如果一个基因同时存在于肺和心脏中，那么我将把它包含在
浏览 0修改于2015-12-07得票数 1
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我正在尝试从imagenet上的预训练模型进行迁移学习，以解决肺CT切片的分类任务。
这些切片存储在dicom文件中，因此它们的值在Hounsfield标度中以12位表示。我的问题是: keras / tf2 api的preprocess_input需要一个0,255的值矩阵，那么我如何对我的图像进行预处理，以便将它们提供给预先训练的convnet？还是强制使用模型的preprocess_input？如果preprocess_input是必需的，我如何映射0,255范围内的12位值
浏览 1修改于2020-06-20得票数 0
我正在处理来自luna16数据集的肺CT图像，数据集有一个三维肺图像和一个来自CSV文件的标签，我有一个从3d数组25x25x25 ( 3d图像)构造2d列表的代码，以及从CSV文件创建一个标签0,1或1,0，在创建了我想要保存在numpy文件中的2d列表之后，下面是我创建2d列表并将其保存到numpy文件中的代码： # receivelist consist of 3d a
浏览 0修改于2018-08-30得票数 2
我在图像1上使用阈值掩码(图2)创建了以下图像(图3)。我试图使用opencv将图像3(肺)中央图像之外的所有像素转换为一种颜色(例如黑色)。我的问题是外部像素和图像3中肺内像素的相似性。这能用opencv吗？
浏览 2提问于2017-11-25得票数 2
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