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我想随机获得很多人类基因组片段(其中5亿多个)。
这是整个过程的部分工作。我有.sam的结果文件从保龄球，与1000万人类基因组读对齐。我希望将每个查询读取与sam文件中的“引用序列”进行比较。
浏览 1提问于2014-04-15得票数 1
需要用来储存单个人类基因组。我在维基百科上读了一些关于DNA、染色体、碱基对、基因的文章，有一些粗略的猜测，但在透露任何东西之前，我想看看其他人是如何处理这个问题的。
浏览 6修改于2019-02-03得票数 97
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有没有人知道是否有可能将SNP坐标从Hapmap数据库转换为新的参考基因组GRCh38。UCSC还没准备好升力器。有什么建议吗？
浏览 1提问于2014-02-20得票数 0
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我想从基因符号(例如: TTN)和基因ID(例如: ENSG00000155657)中获取人类基因组的基因位置。我想用R的biomaRt包来做，怎么做呢？
浏览 12提问于2017-08-29得票数 1
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我想知道谷歌基因组学环境对那些不研究人类基因组的人来说有多灵活？我找不到一个显而易见的地方来回答这个问题，我不想太深入，然后找出它只适合人类。有人知道吗？
浏览 4提问于2016-08-22得票数 0
我知道这可能是php的一个晦涩难懂的用法，但我正在研究一个以一种相当有趣的方式导航人类基因组的想法。
问题是，我需要知道我是否可以写一个php脚本来解析免费可用的数据，如果可以，我该如何开始？
浏览 0提问于2012-01-25得票数 1
在目前的任务中，教授给了我们一个gff文件，其中包含了人类基因组中所有的miRNA基因，注释为基因-MIR。我们应该使用grep，以及正则表达式和其他命令行工具来生成人类基因组中唯一的miRNA名称列表。这看上去相当直截了当，我知道如何做到这一点。但我在整理文件和删除重复行时遇到了困难。
浏览 1修改于2021-09-25得票数 2
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我有3个文件(每个文件大约2 2Gb，包含人类基因组序列)。我有java代码来处理这些文件，通过在PHP开发的web界面。处理时间约为24小时，甚至更长。
浏览 2提问于2011-05-17得票数 0
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value="option1">Option 1</option></select>
我还有一个带有id=“人类基因组
浏览 6修改于2022-02-21得票数 2
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第一列具有人类基因组序列位置，第二列具有对应于每个位置的值。我想从第一列中找到特定位置的行号，然后将这些行读入R中的表中。由于内存问题，我无法导入该文件。
浏览 1修改于2013-08-08得票数 3
所以我有几个很大的文件代表了人类基因组中的每一个位置。这两个文件都是基因组中每个位置的某种类型的“分数”的二进制掩码，我有兴趣获得一个新的掩码，其中两个分数都是"1“，也就是两个掩码的交集。
浏览 4修改于2015-12-09得票数 0
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因此，如果我想找到一种与老鼠基因Card9相匹配的老鼠基因，有两种可能：(一)人类基因组中没有匹配，在这种情况下，gene1列中将有老鼠基因匹配，或者老鼠基因将在gene1中，老鼠基因将在gene2列中；(二)人类(或其他一些)基因组中有匹配，在这种情况下，我首先需要在gene1列中找到人类基因组中的匹配，然后在gene2列中找到与该基因匹配的基因。
浏览 2提问于2020-03-20得票数 1
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使用rep“扩展”数据不是一个选择，因为sum(x$count)大约是30亿(人类基因组的大小)。
浏览 1修改于2017-03-24得票数 4
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找到答案就像试图绘制人类基因组图一样。我只想迭代这些控件。没别的了。
我不想听到我想要做的事情的好处。只是怎么做的机械原理。
浏览 0提问于2018-07-12得票数 0
genome = "sacCer3", chromosome = "chrI")
相反，当我使用人类基因组做同样的操作时
浏览 1修改于2019-06-30得票数 0
例如，在人类基因组 (770MB)中找到"GCAGCTGAAAACA“序列的所有位置
*字母表由4个符号('G'，'C'，T，'A')组成，用2位表示：'G':00，'A':01，'T':10，'C':
浏览 1修改于2017-05-23得票数 3
我目前正在研究两个基因组，一个是出芽酵母基因组(磁盘上有11.5 MB )，另一个是人类基因组(2.8GB)。为什么numpy版本失去了对更大的人类基因组的性能优势？有更快的方法吗？seq_d.values())print 'The parallel version took {} minutes...'.format((e-s)/60)
我还没有在人类基因组上运行过这个
浏览 3修改于2016-09-03得票数 4
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我正在处理人类基因组，在一个患者中有大约1000万个SNP(由“SNP_ID”识别)。我有两个包含行的引用TSV，每行包含一个SNP_ID和一个浮点数(以及许多其他元数据)，它都是ASCII码格式的。
浏览 0提问于2019-09-05得票数 0
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