我能用php解析hg19.2bit吗？
我能用php解析hg19.2bit吗？
提问于 2012-01-25 06:50:51
我知道这可能是php的一个晦涩难懂的用法，但我正在研究一个以一种相当有趣的方式导航人类基因组的想法。
问题是，我需要知道我是否可以写一个php脚本来解析免费可用的数据，如果可以，我该如何开始？有没有现成的php脚本可以做到这一点？
回答 2
Stack Overflow用户
发布于 2012-01-25 07:01:33
我建议创建一个数据库设计(MySQL)，其中包含您想要在应用程序中探索的数据子集。
然后找到一种方法将数据上传到该数据模式中。对于上传部分，你可以选择一种比PHP更强大的语言，它可以是C#、F#、Haskell或其他任何语言。
这种分离将有助于简化工作，而不是全部在PHP中完成。
Stack Overflow用户
发布于 2012-01-25 08:49:32
为此，您必须编写一个解析器，但这应该相当简单：http://jc.unternet.net/genome/2bitformat.html
和一个用Perl编写的例子：http://www.perlmonks.org/?node_id=672251
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/8995443
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