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我正在使用NCBI的SRAtoolkit 2.11.0 mac64。/，如何使用SRAtoolkit？ 谢谢你
浏览 41提问于2021-08-16得票数 0
我一直在使用Unix下载原始读物，使用sratoolkit/2.8.2-1。SRA文件来自NCBI数据库，例如用于"“。
浏览 6提问于2022-06-07得票数 0
[1] 4408 Running /apps1/sratoolkit/2.3.5-2/bin/fastq-dump --split-files SRR1660.sra&
[2] 4415 Running /apps1/sratoolkit/2.3.5-2/bin/fastq-dump --split-files SRR1661.
浏览 0提问于2015-03-24得票数 0
PATH中添加了conda路径：#/usr/softwares/conda/location/bin/conda
#-bash: /usr/softwares/sratoolkit/sratoolkit.2.9.6-ubuntu64/bin:/usr/softwares/conda/location/envs/bioinf/bin:/
浏览 2提问于2019-09-06得票数 4
1回答
我正在尝试使用以下命令下载一些文件：~/source/sratoolkit.2.3.5-2-ubuntu64/bin/prefetch -t ascp -a "~/
浏览 4提问于2014-06-09得票数 0
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prefetch GSM269238
sam-dump C:\Users\Desktop\sratoolkit.2.10.8-win64\bin\ncbi\SRA\sra\GSM2692389.sra
浏览 33修改于2020-09-17得票数 0
因此，我使用SRATOOLKIT下载了sra文件，并在终端使用了以下代码： for n in {141..188}; do prefetch "SRR5577$n"; done 后来，我使用以下命令转换为
浏览 30修改于2020-07-15得票数 1
在du命令之后检查cd：27G Desktop1.8M Maildir318M sratoolkit.2.11.0-ubuntu64
127M sratoolkit.tar.gz
浏览 0修改于2021-03-20得票数 1
dms_tools2.sra.fastqFromSRA( 5 fastq_dump='/home/andreas/sratoolkit
浏览 12修改于2022-01-25得票数 2
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/g'` #Replacing spaces by dots
#/soft/bio/sequence/sratoolkit-2.3.4-2/bin/fastq-dump.2.3.4 --split
浏览 7修改于2015-03-20得票数 3
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Microsoft/Windows/Start Menu/Microsoft R Client/c/Program Files/sratoolkit
浏览 823提问于2019-01-12得票数 0
rsync.macports.org/release/tarballs/ports/net/dnscrypt-proxy/Portfile:/Applications:/Applications:/Applications/sratoolkit
浏览 0修改于2017-05-05得票数 0
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