SRAtoolkit:运行预取时出错:在虚拟文件系统模块中解析树时找不到路径

Question

我一直在使用Unix下载原始读物，使用sratoolkit/2.8.2-1。SRA文件来自NCBI数据库，例如用于"https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRX1157907"“。当我使用预取命令(例如预取SRR2172947)时，始终会出现”在虚拟文件系统模块中解析树时找不到路径“的错误--”SRR2172948“无法找到。我可以下载其他SRA文件，比如SRR12626663，但上面提到的链接有一些问题。

能否请你指导我如何解决这个问题？

Answer 1

NCBI's SRA中的人类基因组数据通常通过dbGaP系统被控制。必须请求访问这些文件，并按照特殊协议下载此类数据。例如，研究人员必须证明有效的研究需要获得访问许可，并同意遵循协议以确保数据被安全地存储。

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