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我使用一个特定的工具箱()来使用MATLAB处理NIfTI文件，但是当我做一个简单的值修改时，与图像相关的空间信息会发生某种改变。我不能直接比较前后的图像，因为它们有不同的起源和/或一些轻微的翻译。我没有(有意)修改NIfTI头信息。matlab_nii.img(matlab.nii.img > 10) = NaN;尽管没有编辑任何头信息，只是直接修改图像值，但新的NIfTI
浏览 3修改于2020-06-20得票数 0
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我有一些维度(50,100，50)的3D nifti文件。我想反转y轴和z轴，这样尺寸就是(50，50,100)。执行此操作的最佳方法是什么，以及如何修改与文件关联的仿射？目前，我正在将nifti文件转换为numpy数组，并像这样交换坐标轴 array = np.asanyarray(niiobj.dataobj)
img_after_resample_swapped_array我知道我可以使用函数nib.Nifti1Image将numpy数组转换为nifti对象，但是我如何修改仿射才能考虑轴的变化呢？ 谢谢你的帮助。
浏览 24提问于2020-06-25得票数 1
我正在加载使用XTK的CT扫描nifti (.nii)图像。我希望修改图像的默认方向并将其翻转，例如在呈现(onShowtime)之前向上/向下或左/右。
浏览 5提问于2013-11-06得票数 1
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我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？
浏览 12修改于2020-08-22得票数 0
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我是nifti世界的初学者，必须将两个niftis (一个分割的白质和一个分割的灰质图像)叠加在一起。我试过用FSLeyes，但我不能把它们保存到一个nifti。
浏览 11修改于2022-10-07得票数 0
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import dicom2niftidicom2nifti.dicom_series_to_nifti('M0_1', 'M0_1.nii.gz')Traceback (most recent call last):\test.py"
浏览 9修改于2022-02-09得票数 1
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我开始使用C++和VTK库，并尝试构建本教程：输入argumentn (对我来说是一个NIFTI文件)必须是元格式的，但我不明白如何用VTK库以这种元格式转换NIFTI文件。有什么想法吗？谢谢！:)
浏览 2修改于2015-08-21得票数 1
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但是当我加载任何NIFTI文件时，我得到了一个大小奇怪的卷，如下所示：我希望体积是197x233x189，但为什么会有两个单一维度和两个空维度对我来说是未知的我不太了解NIFTI格式，也许上面有一个合理的解释？
如果没有，我想以某种方式删除空的维度，这样我就可以得到前三个维度。到目前为止，我还没有幸运地完成一个看似相当简单的操作。
浏览 0提问于2013-08-02得票数 2
我试图用ITK库编写一个简单的程序来读取或可视化nifti图像。我想我应该让3D数组包含不同的像素值(表示nifti图像)。我该用哪种方法？
另外，我尝试使用VTK来可视化图像，并为图像创建新的格式(PNG或PPM)，但我做不到。任何代码示例都是非常感谢的。
浏览 0修改于2020-06-20得票数 1
我在Nifti文件(.ii.gz)中有3D数组，我想将它保存为3D numpy数组。我使用Nibabel将Numpy转换为Nifti1。我可以做相反的事情吗？
浏览 0提问于2017-06-08得票数 6
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我有一个NifTi文件，当我加载它时，值奇怪地分散在int_32的作用域中。但是，当我通过NifTi-Python绑定加载相同的文件时，值范围是不同的并且是正确的。
浏览 1提问于2012-07-18得票数 4
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我在蟒蛇上做单体素模拟，以产生附加噪声的模拟信号.然后，我希望将生成的numpy数组转换为nifti文件，其形状如下(100,100)。
我要用以下格式将这个矩阵保存到一个nifti文件中(10，10，1,100)。converted_array = np.array(data, dtype=np.float32)nib.
浏览 5修改于2021-12-17得票数 1
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我想使用scikit学习机器学习变体来对我的神经成像数据进行数据处理，特别是Nifti文件类型的fMRI数据。
尼勒恩提供了这个平台。但是，我不明白的工作原理。
浏览 4提问于2016-03-07得票数 1
对于我正在做的一个项目，我想写一个脚本，可以计算nifti格式(.nii扩展)的核磁共振图像的总脑体积。我不知道怎么做的是循环遍历所有独立的体素，并提取其中的整数数据。有人知道怎么做吗？这是我用来在Python中加载特定nifti图像的代码： import nibabel as nibimport os
data shape (166, 256, 256)[
浏览 10提问于2019-01-04得票数 0
我正在使用包含Nifti文件的COBRE脑部MRI数据集。我可以想象它们，但无法理解如何用正确的格式在深度学习中使用。我读过尼尔森的文档，但他们只对一个主题使用了一个.nii文件示例。Nifti文件由150片组成，每个受试者的大脑。
第三件事是如何为模型提供标签？数据集不包含任何掩码。如何为特定文件提供模型特定的标签？
浏览 5修改于2022-06-06得票数 0
我正在尝试使用python在vtk中加载一个NIFTI镜像。数据已经使用nibabel加载，我可以使用pyplot (每个图1个切片，我的数据是ndarray)来可视化它。
浏览 3修改于2015-06-10得票数 5
尝试使用nibabel从dicom转到nifti。为了寻找单独保存标题和图像的方法，我完成了其余的工作。nibabel.Nifti1Header有一个write_to函数，但只接受一个fileobj。如何将带有保存文件路径名的Nifti1Header实例传递给该方法？
浏览 3修改于2017-02-01得票数 0
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