如何从nifti文件构建CNN？

Question

我正在使用包含Nifti文件的COBRE脑部MRI数据集。我可以想象它们，但无法理解如何用正确的格式在深度学习中使用。我读过尼尔森的文档，但他们只对一个主题使用了一个.nii文件示例。问题是如何将100个.nii文件提供给CNN？

第二件事是如何确定应该使用文件的哪个片段？应该是中间的吗？Nifti文件由150片组成，每个受试者的大脑。

第三件事是如何为模型提供标签？数据集不包含任何掩码。如何为特定文件提供模型特定的标签？我是否应该创建一个包含.nii文件及其相关标签的路径的csv文件？

请解释我或建议我一些资源为同样的。

Answer 1

嗨，我最近开始为我的一个项目处理nii文件。我可以在某些级别(预处理)得到突破，但还没有达到模型级别。

对于你的第二个问题，通常由一位专家想象niis，并提供roi(感兴趣区域)的位置。

我目前正在用标签将nii解析为csv格式。因此，第三个问题的答案是，我们可以根据roi位置来确定坐标(x，y，z，c，t)。(在需要的基础上，我可能需要纠正这种理解，但就目前而言，这是将数据集提供给我要遵循的模型的方法)