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我在Windows桌面上以多线程模式运行python Emcee MCMC代码时遇到了问题。它只有一个线程就能很好地运行，在我的Mac笔记本电脑上以单线程或多线程模式运行。以下是简单的示例代码(取自Emcee网站示例)。import numpy as np return -0.5 * np.sum(ivar * x ** 2)
ivar = 1. / np.random.rand(ndim)
p0 = [np.random.rand
浏览 35修改于2017-09-24得票数 1
我在使用get_chain()方法访问从emcee生成的值时遇到问题。我的代码如下： import numpy as npdef log_prob(x): return -np.sum(x**2)sampler = emcee.EnsembleSampler(12, 1, log_prob)samples = sampler.get_chain我在网上读到get_chain()方法
浏览 21提问于2020-06-30得票数 0
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然而，当我试图用emcee估计后验时，我只是简单地抽样了链的初始起点。import numpy as np import emcee import= [np.array(p0) + 5e-1*np.random.randn(ndim) for i in range(nwalkers)]
sampler = emcee.EnsembleSampler我觉得这个行为有点奇怪，所以
浏览 3修改于2019-06-09得票数 0
我想在朱莉娅中使用Python的，所以在做了一些研究之后，我找到了，然后根据他们的文档，我不得不使用@pyimport emcee错误: PyError (ccall(@pysym(:PyImport_ImportModule)，PyPtr，(Cstring，)，name)
pyimport找不到Python包emcee。通常，这意味着您没有在PyCall使用的Python版本中安装emcee。PyCall目前被配置为使用由Conda.jl包安装的特定于朱莉娅的Python发行版。要安装e
浏览 9提问于2017-11-14得票数 0
我尝试使用库来实现类内的Monte马尔可夫链，并使多处理模块工作，但在运行了这样的测试代码之后：import emcee self.sampler.run_mcmc(theta0, nstep) File &q
浏览 3修改于2017-09-24得票数 0
我正在使用emcee在Python中运行MCMC进程。我的python代码是一个不同软件的包装器。emcee步行器对此软件的输入参数空间进行采样。软件读取一个文本文件作为其输入。我的代码使用emcee链的每个步骤生成这个文本文件。为了加快采样速度，我希望并行运行多个评估对数似然率的进程。但是，这些进程中的每个进程都需要写入不同的输入文本文件，以防止进程之间的干扰。为此，我使用multiprocessing中的Pool手动创建并行进程，而不是使用emcee中的默认选项。我知道为了让不同的并行进程生成不同的随机数，我需要为每个
浏览 103修改于2020-03-16得票数 2
我使用emcee软件包来确定应该遵循泊松分布的测量数据集的最佳参数。Traceback (most recent call last) 1 sampler_2 = emcee.EnsembleSampler=[0.16, 0.5, 0.84], show_titles=True,label_kwargs=dict(fontsize=15))
~\Anaconda3\lib\site-packages\emceeini
浏览 9修改于2021-04-13得票数 0
这是我所拥有的；import numpy as np xrange
sampler = emcee.EnsembleSampler
浏览 5修改于2017-09-24得票数 1
我正在使用来分析一些与SN1a相关的数据。在处理真实数据之前，我从模拟数据开始。我所取得的结果似乎是好的：现在，我要计算一些量的后验，例如用我为q和j得到的后验，有人能帮我吗？
浏览 2修改于2018-09-25得票数 1
我正在尝试让emcee在Slurm集群上使用mpi运行，但当我启动我的代码时，它在几分钟后返回一个错误，下面描述了一个大错误，似乎是围绕着“Invalid communicator”错误。-3.0rc2-py3.7.egg/emcee/ensemble.py", line 346, in run_mcmc
File "/home/mbenisty/anaconda3/envs/EmceeMPI/lib/python3.7/site-pa
浏览 79修改于2019-06-22得票数 0
我试图使用emcee模块重新创建一个发行版。np.asarray(seps).reshape((Ntrig,Nsamp)) #TODO: find a better way to pass a variable number of arguments to emceenp.asarray(seps).reshape((Ntrig,Nsamp)) #TODO: find a better way to pass a variable number of arguments to emcee
浏览 1修改于2017-09-24得票数 1
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我现以以下方式说明我的前科是没有负面的： sig,mu = theta return(0.0)然后，我按照网页上的食谱： lp = lnprior(theta) return(-np.inf)
return(
浏览 0修改于2017-10-29得票数 0
我正在使用emcee文档中所述的多处理模块来并行化emcee。然而，htop显示程序继续使用有限数量的内核(26-27)。我运行代码的计算机有80个可用内核，我想利用它们来加速代码。
浏览 44修改于2021-09-21得票数 0
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我正在使用emcee.EnsembleSampler对一些可能性进行采样。我在数百万个不同的数据集上这样做，因此性能很重要。
浏览 4提问于2018-05-11得票数 1
我已经使用EMCEE Python包为MCMC编写了以下代码 在log_prior函数中，我定义了要在它们之间移动的参数范围，而不是它们之外的参数。
浏览 15修改于2019-04-21得票数 1
我正试图通过将聚合物集成到Rails 4应用程序中。我不能让网页组件中的图标(例如，图标-“搜索”中的纸图标-按钮)呈现在火狐。不过，图标本身就能发挥作用。而且，这个问题在Chrome中不会出现。我怀疑是管道问题。如有必要，可进行清洁处理。 *= require polymer/polymer *= require core-toolbar/core-toolbar
*= require paper-button/paper-b
浏览 1修改于2014-11-23得票数 1
我试着为python安装'emcee‘。好像很管用。首先，我尝试了下面的示例--
我想得到像在这个例子中这样的角点，所以我也必须安装“角”。这是失败的。
浏览 0修改于2019-05-22得票数 0
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